特許
J-GLOBAL ID：202003002997715280
単一生物単位の配列情報の新規処理法
発明者：
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出願人/特許権者：
代理人 (6件)：
山本 秀策
, 森下 夏樹
, ▲駒▼谷 剛志
, 飯田 貴敏
, 石川 大輔
, 山本 健策
公報種別：特許公報
出願番号（国際出願番号）：特願2020-018906
特許番号：特許第6744648号
出願日： 2020年02月06日
要約：
【課題】微生物ゲノムデータ自動的構築・提供システムを提供する。
【解決手段】単一生物単位の配列情報を処理する方法であって、該方法は:
(A)複数の単一(single)生物単位(例えば、細胞)のゲノム(または同等の遺伝子集合)の部分配列情報(スライドでは、SAG)について、生物系統同定用配列(16S rRNAまたはマーカー遺伝子)に基づいて、同一系統ごとにクラスター化するステップと、(B)必要に応じて、データベース中の該単一生物単位のゲノムの情報と照合するステップとを含む方法。
【選択図】なし
請求項（抜粋）：
【請求項1】 単一(single)生物単位の配列情報の処理をコンピュータに実行させる指令を発する方法であって、該指令を受けた該コンピュータは:
(A)複数の単一生物単位の配列情報の部分配列情報について、生物系統同定用配列に基づいて、同一系統ごとにクラスター化するステップと、
(D)(A)により得られたクラスター内の複数の単一生物単位の配列情報の部分配列情報を、所定の判断基準に基づいて高品質のものから順位付けするステップと、
(E)該順位付けに基づいて、高順位のものから、該複数の単一生物単位の配列情報の部分配列情報のうち所定の数の集合を選択して、該部分配列情報から該部分配列情報より大きな長さのドラフトを構築するステップと、
(E’)該集合とは異なる数の単一生物単位の配列情報の部分配列情報のセットの集合を選択して、該部分配列情報から該部分配列情報より大きな長さのドラフトを構築し、それまでに生成したドラフトを、所定の判断基準に基づいて選択するステップと
を実行する、方法。
IPC (1件)：
FI (1件)：
引用特許：
引用文献：
審査官引用 (1件)
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Obtaining high-quality draft genomes from uncultured microbes by cleaning and co-assembly of single-
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