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J-GLOBAL ID：202102210159808970   整理番号：21A0291290

マウス糞便中のAspiculurisテトラpteraDNAに対するLNAベースTaqManアッセイqPCR分析の標準化【JST・京大機械翻訳】

Standardization of an LNA-based TaqMan assay qPCR analysis for Aspiculuris tetraptera DNA in mouse faeces

著者 (5件)： Isayama Keishiro (Institute of Laboratory Animals, Yamaguchi University Science Research Center, Yamaguchi, Japan) ,  Watanabe Kenji (Institute of Gene Research, Yamaguchi University Science Research Center, Yamaguchi, Japan) ,  Okamoto Mariko (Laboratory of Veterinary Immunology, School of Veterinary Medicine, Azabu University, Sagamihara, Japan) ,  Murata Tomoaki (Institute of Laboratory Animals, Yamaguchi University Science Research Center, Yamaguchi, Japan) ,  Mizukami Yoichi (Institute of Gene Research, Yamaguchi University Science Research Center, Yamaguchi, Japan)
資料名： BMC Microbiology (Web)  (BMC Microbiology (Web))
巻： 20  号： 1  ページ： 1-12  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7367A  ISSN： 1471-2180  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 寄生性ピンワームとしてのAspiculurisテトラプテラは,実験室マウスにおいて最も頻繁に検出され,感染マウスの糞便に含まれる卵により伝達が媒介される。高感度かつ定量的糞便に基づく診断ツールは,感染の拡大を阻害するA.tetraperaの早期検出に有用である。本研究では,PCR法を用いて,糞便中のA.tetrapteraの検出において高感度を示す定量アッセイを開発した。エンドポイントPCRは,感染マウスの糞便から抽出した0.5ngゲノムDNAにおけるA.tetraptera DNAの検出を示した。少量のA.tetraptera DNAを定量的に検出するために,ロック核酸(LNA)に基づくプライマーとLNAに基づくTaqManプローブを定量的PCRアッセイ(qPCR)に用いた。LNAに基づくDNAの組み合わせは,正常オリゴDNAを用いた場合と比較して,検出感度を100倍以上増加させた。検出されたA.tetraptera DNAのコピー数は,ゲノムDNAの20pgから15ngの範囲の単純な直線性回帰で,感染した糞便由来ゲノムDNAと正相関した。糞便を用いた感染をより簡便に検出するために,LNAに基づくTaqManアッセイをDNA精製のない糞便の粗画分に適用した。糞便のエタノール沈殿を用いた分析は,直接顕微鏡観察の結果と一致する結果をもたらした。本研究で開発したLNA-TaqManアッセイは,マウス糞便におけるA.tetraptera感染を定量的に検出する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： プローブ ,  *標準化 ,  沈殿 ,  *DNA【核酸】 ,  顕微鏡観察 ,  線形性 ,  高感度 ,  順相 ,  コピー数 ,  PCR法 ,  *定量的PCR法 ,  脂肪族アルコール
準シソーラス用語： 検出能 ,  オリゴデオキシヌクレオチド ,  ゲノムDNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ロック核酸 ,  TaqManアッセイ ,  A.tetraptera ,  マウス ,  PCR ,  糞便

分類 (1件)： 微生物検査法  (EG02020G)

物質索引 (1件)： エタノール

引用文献 (30件)：

• J Am Assoc Lab Anim Sci; Interspecies variation in the susceptibility of a wild-derived colony of mice to pinworms (Aspiculuris tetraptera); RC Curtis, JK Murray, P Campbell, Y Nagamori, A Molnar, TA Jackson; 56; 1; 2017; 42-46; citation_id=CR1
• Lab Anim; Pinworm infections in laboratory rodents: a review; LF Taffs; 10; 1; 1976; 1-13; 10.1258/002367776780948862; citation_id=CR2
• J Am Assoc Lab Anim Sci; False-positive results after environmental pinworm PCR testing due to Rhabditid nematodes in corncob bedding; M Leblanc, K Berry, S Graciano, B Becker, JD Reuter; 53; 6; 2014; 717-724; citation_id=CR3
• J Am Assoc Lab Anim Sci; Evaluation of traditional and contemporary methods for detecting Syphacia obvelata and Aspiculuris tetraptera in laboratory mice; PM Gerwin, RJ Ricart Arbona, ER Riedel, ML Lepherd, KS Henderson, NS Lipman; 56; 1; 2017; 32-41; citation_id=CR4
• Vet Parasitol; Characterization of rDNA sequences from Syphacia obvelata, Syphacia muris, and Aspiculuris tetraptera and development of a PCR-based method for identification; JD Parel, JU Galula, HK Ooi; 153; 3-4; 2008; 379-383; 10.1016/j.vetpar.2008.02.001; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (8件)： マウス ,  糞便 ,  テトラ ,  LNA ,  アッセイ ,  qPCR ,  分析 ,  標準化