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J-GLOBAL ID：202102215058667194   整理番号：21A2113482

分子クラウディング条件下の三重安定性に対するカリウム濃度の影響【JST・京大機械翻訳】

Effect of Potassium Concentration on Triplex Stability under Molecular Crowding Conditions

著者 (6件)： Teng Ye (Frontier Institute for Biomolecular Engineering Research (FIBER), Konan University, 7-1-20 Minatojima-Minamimachi, Chuo-ku, Kobe 650-0047, Japan) ,  Teng Ye (School of Pharmacy, Changchun University of Chinese Medicine, 1035 Boshuo Road, Changchun 130117, China) ,  Tateishi-Karimata Hisae (Frontier Institute for Biomolecular Engineering Research (FIBER), Konan University, 7-1-20 Minatojima-Minamimachi, Chuo-ku, Kobe 650-0047, Japan) ,  Ohyama Tatsuya (Frontier Institute for Biomolecular Engineering Research (FIBER), Konan University, 7-1-20 Minatojima-Minamimachi, Chuo-ku, Kobe 650-0047, Japan) ,  Sugimoto Naoki (Frontier Institute for Biomolecular Engineering Research (FIBER), Konan University, 7-1-20 Minatojima-Minamimachi, Chuo-ku, Kobe 650-0047, Japan) ,  Sugimoto Naoki (Graduate School of Frontiers of Innovative Research in Science and Technology (FIRST), Konan University, 7-1-20 Minatojima-Minamimachi, Chuo-ku, Kobe 650-0047, Japan)
資料名： Molecules (Web)  (Molecules (Web))
巻： 25  号： 2  ページ： 387  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7014A  ISSN： 1420-3049  CODEN： MOLEFW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： G-四重螺旋および三重螺旋のような非標準DNA構造の特性は,希釈水溶液と比較して細胞模倣分子密集条件下で変化した。それらの安定性に対する環境効果の分析は,それらが遺伝子発現と調節において重要な役割を果たすので重要である。本研究では,異なるC+*G-C三重項含有量(*:Hogosten 塩基対;-:WatsonCrick塩基対)の3つの分子内および分子間三重鎖形成配列を設計し,それらの安定性を,異なるK+濃度を有するクラウディング剤の有無において測定した。希薄溶液中では,三重螺旋の安定性はKCl濃度の減少によって低下した。この還元はC+*G-C三重項の数が増加するにつれて小さくなった。分子密集条件下で,WatsonCrick塩基対とHoogsteen塩基対はそれぞれ不安定化した。興味深いことに,より低いKCl濃度(1M)では,KCl濃度の減少による三重螺旋の不安定化は希薄溶液中よりも著しく小さかった。加えて,C+*G-C含有量は,分子クラウディング条件下で3倍安定性に大きい影響を及ぼした。本研究は,分子密集条件下での三重安定性に対するK+濃度の影響に関する定量的情報を提供し,バイオプロセスにおける三重螺旋の機能と調節の理解を深めるべきである。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *カリウム ,  核酸 ,  塩基対 ,  環境効果 ,  *こみあい効果 ,  希薄溶液 ,  遺伝子発現 ,  三重螺旋 ,  *分子集合体
準シソーラス用語： G-四重鎖 ,  不安定化 ,  バイオプロセス ,  DNA構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 分子クラウディング ,  三重安定性 ,  核酸

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  分子構造  (EB03020Y)

引用文献 (23件)：

• Zhao, J.; Bacolla, A.; Wang, G.; Vasquez, K.M. Non-B DNA Structure-Induced Genetic Instability and Evolution. Cell. Mol. Life Sci. 2010, 67, 43-62.
• Bacolla, A.; Wojciechowska, M.; Kosmider, B.; Larson, J.E.; Wells, R.D. The Involvement of non-B DNA Structures in Gross Chromosomal Rearrangements. DNA Repair 2006, 5, 1161-1170.
• Wells, R.D. Non-B DNA Conformations, Mutagenesis and Disease. Trends Biochem. Sci. 2007, 32, 271-278.
• Tateishi-Karimata, H.; Isono, N.; Sugimoto, N. New Insights into Transcription Fidelity: Thermal Stability of Non-Canonical Structures in Template DNA Regulates Transcriptional Arrest, Pause, and Slippage. PLoS ONE 2014, 9, e90580.
• Cooney, M.; Czernuszewicz, G.; Postel, E.H.; Flint, S.J.; Hogan, M.E. Site-Specific Oligonucleotide Binding Represses Transcription of the Human c-myc Gene in Vitro. Science 1988, 241, 456-459.

タイトルに関連する用語 (4件)： 分子クラウディング ,  三重 ,  安定性 ,  カリウム