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J-GLOBAL ID：202102229077520416   整理番号：21A2843802

バングラデシュとタイにおけるチクングニアウイルス東/中央/南アフリカ遺伝子型インド洋系統の新しい亜系列は逐次発生を引き起こす【JST・京大機械翻訳】

A Novel Sub-Lineage of Chikungunya Virus East/Central/South African Genotype Indian Ocean Lineage Caused Sequential Outbreaks in Bangladesh and Thailand

著者 (20件)： Phadungsombat Juthamas (Mahidol-Osaka Center for Infectious Diseases, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Imad Hisham (Mahidol-Osaka Center for Infectious Diseases, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Imad Hisham (Hospital for Tropical Diseases, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Rahman Mizanur (Apollo Hospitals Dhaka (presently Evercare Hospital Dhaka), Dhaka 1229, Bangladesh) ,  Nakayama Emi E. (Research Institute for Microbial Diseases, Osaka University, Osaka 565-0871, Japan) ,  Kludkleeb Sajikapon (Hospital for Tropical Diseases, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Kludkleeb Sajikapon (Department of Clinical Tropical Medicine, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Ponam Thitiya (Hospital for Tropical Diseases, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Rahim Rummana (Apollo Hospitals Dhaka (presently Evercare Hospital Dhaka), Dhaka 1229, Bangladesh) ,  Hasan Abu (Apollo Hospitals Dhaka (presently Evercare Hospital Dhaka), Dhaka 1229, Bangladesh) ,  Poltep Kanaporn (Mahidol-Osaka Center for Infectious Diseases, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Yamanaka Atsushi (Mahidol-Osaka Center for Infectious Diseases, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Matsee Wasin (Hospital for Tropical Diseases, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Matsee Wasin (Department of Clinical Tropical Medicine, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Piyaphanee Watcharapong (Hospital for Tropical Diseases, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Piyaphanee Watcharapong (Department of Clinical Tropical Medicine, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Phumratanaprapin Weerapong (Hospital for Tropical Diseases, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Phumratanaprapin Weerapong (Department of Clinical Tropical Medicine, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Shioda Tatsuo (Mahidol-Osaka Center for Infectious Diseases, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok 10400, Thailand) ,  Shioda Tatsuo (Research Institute for Microbial Diseases, Osaka University, Osaka 565-0871, Japan)
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 12  号： 11  ページ： 1319  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ここ数十年間,キクングニアウイルス(CHIKV)は地理的に広まっている。2004年に,CHIKV East/Central/南アフリカ(ECSA)遺伝子型はアフリカからインドの海洋島とインドに移動し,続いて東南アジアで大きな流行が続いた。2013年には,CHIKVアジア遺伝子型はアメリカで流行している。2016年以降,CHIKVはインド亜大陸と東南アジアに再出現した。本研究では,CHIKVを2017年のバングラデシュと2019年のタイ国から得て,それらのほぼ完全なゲノムを配列決定した。系統発生分析は,最近のCHIKVが,以前の発生と同様に,遺伝子型ECSAのインド洋系統(IOL)であることを明らかにした。しかし,これらのCHIKVは,過去のIOL CHIKVから離れて新しい異なるサブラインにクラスタ化され,それらは,Aedes albopictusにおけるCHIKV複製を増強するE1エンベロープ糖蛋白質の位置226でアラニンからバリンへの置換を欠いている。代わりに,すべての再出現CHIKVは,E1の211位でのリジンからグルタミン酸の突然変異とE2の264位のバリンからアラニンへの変異を持っていた。分子時計分析は,新しいサブラインCHIKVが2015年後期にバングラデシュに,また2017年初期にタイ国に導入されたことを示唆した。これらの結果は,再出現CHIKVが以前のCHIKVよりも異なる適応を獲得したことを示唆する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子型 ,  突然変異 ,  インド ,  バングラデシュ人民共和国 ,  クラスタ化 ,  ゲノム ,  東南アジア ,  アフリカ ,  インド洋 ,  ヒトスジシマカ ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  第一アミン ,  ジカルボン酸 ,  分枝鎖アミノ酸
準シソーラス用語： 系統解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： チクングニアウイルス ,  東/中央/南アフリカの遺伝子型 ,  インド洋の系譜 ,  発生 ,  分子時計解析 ,  バングラデシュ ,  タイ国 ,  蚊

分類 (2件)： ウイルスの形態学,分類学  (EG04020U) ,  ウイルスの生化学  (EG04030F)

物質索引 (4件)： アラニン ,  グルタミン酸 ,  リジン ,  バリン

引用文献 (63件)：

• Halstead, S.B. Reappearance of chikungunya, formerly called dengue, in the Americas. Emerg. Infect. Dis. 2015, 21, 557-561.
• Volk, S.M.; Chen, R.; Tsetsarkin, K.A.; Adams, A.P.; Garcia, T.I.; Sall, A.A.; Nasar, F.; Schuh, A.J.; Holmes, E.C.; Higgs, S.; et al. Genome-scale phylogenetic analyses of chikungunya virus reveal independent emergences of recent epidemics and various evolutionary rates. J. Virol. 2010, 84, 6497-6504.
• Weaver, S.C.; Chen, R.; Diallo, M. Chikungunya Virus: Role of Vectors in Emergence from Enzootic Cycles. Annu. Rev. Entomol. 2020, 65, 313-332.
• Weaver, S.C. Arrival of chikungunya virus in the new world: Prospects for spread and impact on public health. PLoS Negl. Trop. Dis. 2014, 8, e2921.
• Schuffenecker, I.; Iteman, I.; Michault, A.; Murri, S.; Frangeul, L.; Vaney, M.C.; Lavenir, R.; Pardigon, N.; Reynes, J.M.; Pettinelli, F.; et al. Genome microevolution of chikungunya viruses causing the Indian Ocean outbreak. PLoS Med. 2006, 3, e263.

タイトルに関連する用語 (8件)： バングラデシュ ,  タイ ,  チクングニアウイルス ,  南アフリカ ,  遺伝子型 ,  インド洋 ,  系統 ,  系列