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J-GLOBAL ID：202102243327667313   整理番号：21A0195879

「培養不能」地下微生物の培養:天然有機炭素源は地下水からの多様な細菌と異なる細菌の増殖を燃料する【JST・京大機械翻訳】

Culturing of “Unculturable” Subsurface Microbes: Natural Organic Carbon Source Fuels the Growth of Diverse and Distinct Bacteria From Groundwater

著者 (8件)： Wu Xiaoqin (Department of Ecology, Earth and Environmental Sciences Area, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, United States) ,  Spencer Sarah (Department of Biological Engineering, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, United States) ,  Gushgari-Doyle Sara (Department of Ecology, Earth and Environmental Sciences Area, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, United States) ,  Yee Mon Oo (Department of Ecology, Earth and Environmental Sciences Area, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, United States) ,  Voriskova Jana (Department of Ecology, Earth and Environmental Sciences Area, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, United States) ,  Li Yifan (Department of Ecology, Earth and Environmental Sciences Area, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, United States) ,  Alm Eric J. (Department of Biological Engineering, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, United States) ,  Chakraborty Romy (Department of Ecology, Earth and Environmental Sciences Area, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, United States)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 11  ページ： 610001  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 陸生地下からの多様な環境関連微生物の回収と培養は,最近の分子技術における最近の進歩にもかかわらず,課題のままである。ここでは,複雑な炭素(C)源,すなわち堆積物溶解有機物(DOM)と細菌細胞溶解物を適用し,30日間地下水微生物群集を濃縮した。比較として,グルコース,酢酸塩,安息香酸塩,オレイン酸,セルロースおよび混合ビタミンを含む簡単なC源で改良した濃縮も含めた。著者らの結果は,複雑なCが,単純なCより地下水から多様で異なる微生物を濃縮するのにはるかに効果的であることを示す。単純なC富化は生物多様性を著しく低下させ,少数の門(例えばProteobacteriaとBacteroidetes)が優勢であり,一方,複雑なCに富むミクロコスムは,公表された培養収集(例えばVerrucomicrobia,プランクトミケス門,およびArmatimonadetes)であまり表現されていない門を含む著しく高い生物多様性を示す。複雑なC濃縮からのその後の単離は,5つの門,17の目,および56の異なる種を代表する228の細菌分離株をもたらし,候補の新規な,稀に栽培された,そして,未記載の生物を含んだ。本研究の結果は,多様で新しい地下微生物を回収するための栽培と単離戦略を大きく進めるであろう。「once-uncuturable」微生物の獲得性代表を得ることは,陸生地下生態系の異なる生物地球化学的ニッチにおける微生物生理学と機能の理解を高めるであろう。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 溶解 ,  *微生物 ,  セルロース ,  *細菌 ,  栽培 ,  *有機炭素 ,  生態系 ,  生物多様性 ,  不飽和脂肪酸 ,  オレフィン化合物 ,  ヘキソース ,  アルドース
準シソーラス用語： バクテロイデス門 ,  プロテオバクテリア ,  マイクロコズム ,  *炭素源 ,  陸生 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 天然有機炭素 ,  希少栽培 ,  新しいもの ,  微生物 ,  地下水 ,  地下表面 ,  栽培 ,  分離

分類 (2件)： 水質汚濁一般  (SB02010U) ,  微生物の生態  (EG03040J)

物質索引 (2件)： オレイン酸 ,  グルコース

引用文献 (56件)：

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• BarbieriE.PotenzaL.RossiI.SistiD.GiomaroG.RossettiS.. (2000). Phylogenetic characterization and in situ detection of a cytophaga-flexibacter-bacteroides phylogroup bacterium in tuber borchii vittad, ectomycorrhizal mycelium. Appl. Environ. Microbiol. 66, 5035-5042. doi: doi: 10.1128/AEM.66.11.5035-5042.2000, PMID: 11055961
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• BollmannA.LewisK.EpsteinS. S. (2007). Incubation of environmental samples in a diffusion chamber increases the diversity of recovered isolates. Appl. Environ. Microbiol. 73, 6386-6390. doi: doi: 10.1128/AEM.01309-07, PMID: 17720826

タイトルに関連する用語 (8件)： 培養 ,  地下 ,  微生物 ,  有機炭素 ,  地下水 ,  細菌 ,  増殖 ,  燃料