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J-GLOBAL ID：202102245883392799   整理番号：21A2282018

環境DNAによる魚類の網羅的解析の河川水辺の国勢調査への導入に関する検討

Consideration on the application of exhaustive analysis of fish with environmental DNA to the National Census on River Environments

著者 (6件)： 内藤太輔 (リバーフロント研) ,  都築隆禎 (リバーフロント研) ,  蔭山一人 (リバーフロント研) ,  宮本健也 (リバーフロント研) ,  赤松良久 (山口大 大学院) ,  乾隆帝 (福岡工大)
資料名： リバーフロント研究所報告(CD-ROM)  (Report of Japan Riverfront Research Center (CD-ROM))
号： 31  ページ： 9-16  発行年： 2020年09月30日 
JST資料番号： L4833B  ISSN： 2758-4836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 環境DNA分析技術の一つメタバーコーディング解析は,特定の分類群のDNA情報を網羅的に検出するものであり,特に魚類を対象とした研究や技術は,種判別に必要なDNAデータが充実していることなどを背景として,近年の発展が著しい。本研究では,このメタバーコーディング解析の河川水辺の国勢調査(魚類調査)への導入を検討するため,現行の採捕調査とあわせて環境DNA調査を行い,環境区分(50~100mスケール),調査地区(約1kmスケール)および河川全体で,検出・確認種数を比較した。4河川15調査地区48環境区分を対象とした調査,分析では,3つのスケールすべてにおいて,全体平均では,環境DNA調査による検出数が採捕調査による確認種数を上回った。また,採捕調査による確認種数のうち環境DNA調査で検出できた種の割合(整合率)は,環境区分では,約6割程度であったのに対して,調査地区,河川全体では7割を越えた。一方で,大型で複雑な形のワンドでは,検出数が確認数を下回ることが確認された。さらに,下層の水をサンプルした環境DNA分析では,表層水のみの分析結果では漏れていた底生魚類を検出できたので,併せてその結果を報告する。(著者抄録)

シソーラス用語： *DNA【核酸】 ,  *魚類 ,  *解析 ,  河川 ,  水辺 ,  国勢調査 ,  同定 ,  生物分類 ,  検出 ,  遊水池
準シソーラス用語： DNAバーコーディング ,  DNA分析 ,  ワンド ,  *環境DNA ,  魚類調査 ,  検出率 ,  採捕 ,  種数 ,  種判別 ,  分類群 ,  *網羅的解析

分類 (2件)： 河川調査・計画  (RC12020M) ,  動物生態学一般  (EE03010W)

引用文献 (15件)：

• 河川環境データベース:国土交通省 http://mizukoku.nilim.go.jp/ksnkankyo
• 源利文:種特異的な環境DNA検出によるマクロ生物の生態調査,水環境学会誌 Vol.41(A),2018
• Miya, Sato, Fukunaga, Poulsen, Sato, Minamoto, Yamamoto, Yamanaka, Araki, Kondoh, Iwasaki: MiFish, a set of universal PCR primers for metabarcoding environmental DNA from fishes: detection of more than 230 subtropical marine species. Royal Society Open Science, 2:150088, 2016
• Nakagawa, H., Yamamoto, S., Sato, Y., Sado, T., Minamoto, T., Miya, M.: Comparing local- and regional-scale estimations of the diversity of stream fish using eDNA metabarcoding and conventional observation methods. Freshwater Biology 63,2018
• 赤松良久,都築隆禎,横山良太,舟橋弥生,太田宗宏,畔上雅樹,内藤太輔,乾隆帝:河川水辺の国勢調査による魚類相調査と環境 DNA メタバーコーディング解析の比較検討,土木学会論文集 B1(水工学) Vol.74,2018

タイトルに関連する用語 (5件)： 環境DNA ,  魚類 ,  網羅的解析 ,  河川水 ,  国勢調査