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J-GLOBAL ID：202102245950658115   整理番号：21A0290286

膵管腺癌原発腫瘍および転移性病変の腫瘍および間質区画の単一細胞トランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

Single-cell transcriptome analysis of tumor and stromal compartments of pancreatic ductal adenocarcinoma primary tumors and metastatic lesions

著者 (18件)： Lin Wei (Molecular Medicine Division, Translational Genomics Research Institute, Phoenix, USA) ,  Noel Pawan (Molecular Medicine Division, Translational Genomics Research Institute, Phoenix, USA) ,  Borazanci Erkut H. (Molecular Medicine Division, Translational Genomics Research Institute, Phoenix, USA) ,  Borazanci Erkut H. (HonorHealth Research Institute, Scottsdale, USA) ,  Lee Jeeyun (Samsung Medical Center, Sungkyunkwan University School of Medicine, Seoul, South Korea) ,  Amini Albert (HonorHealth Research Institute, Scottsdale, USA) ,  Han In Woong (Samsung Medical Center, Sungkyunkwan University School of Medicine, Seoul, South Korea) ,  Heo Jin Seok (Samsung Medical Center, Sungkyunkwan University School of Medicine, Seoul, South Korea) ,  Jameson Gayle S. (HonorHealth Research Institute, Scottsdale, USA) ,  Fraser Cory (HonorHealth Research Institute, Scottsdale, USA) ,  Steinbach Margaux (HonorHealth Research Institute, Scottsdale, USA) ,  Woo Yanghee (Department of Surgery, City of Hope National Medical Center, Duarte, USA) ,  Fong Yuman (Department of Surgery, City of Hope National Medical Center, Duarte, USA) ,  Cridebring Derek (Molecular Medicine Division, Translational Genomics Research Institute, Phoenix, USA) ,  Hoff Daniel D. Von (Molecular Medicine Division, Translational Genomics Research Institute, Phoenix, USA) ,  Hoff Daniel D. Von (HonorHealth Research Institute, Scottsdale, USA) ,  Park Joon Oh (Samsung Medical Center, Sungkyunkwan University School of Medicine, Seoul, South Korea) ,  Han Haiyong (Molecular Medicine Division, Translational Genomics Research Institute, Phoenix, USA)
資料名： Genome Medicine (Web)  (Genome Medicine (Web))
巻： 12  号： 1  ページ： 1-14  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7320A  ISSN： 1756-994X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 膵管腺癌(PDAC)のような固形腫瘍は腫瘍細胞だけでなく,腫瘍細胞が常に相互作用する微小環境も含む。腫瘍微小環境の細胞組成の詳細な特性化は,患者の疾患と治療の理解に重要である。単一細胞トランスクリプトミクスを用いてPDACを含む異なる固形腫瘍型の細胞組成を調べた。しかし,これらの研究のほとんど全ては原発性腫瘍組織を使用した。本研究では,単一細胞RNA配列決定技術を用いて,PDAC患者から得た解離原発腫瘍または転移性生検から個々の細胞のトランスクリプトームをプロファイル化した。教師なしクラスタリング解析と新しい教師つき分類アルゴリズムSuperCTを用いて,腫瘍組織内の異なる細胞型を同定した。異なる細胞型の発現シグネチャを,原発腫瘍と転移性生検の間で比較した。細胞型特異的シグネチャ遺伝子の発現も,公開データセットを用いた患者生存と相関した。著者らの単細胞RNA配列決定分析は,腫瘍細胞,内皮細胞,癌関連線維芽細胞(CAFs),および免疫細胞を含む一次および転移性PDAC組織における異なる細胞型を明らかにした。癌細胞は高い患者間不均一性を示したが,間質細胞は患者全体でより均一であった。免疫浸潤は,マクロファージおよび消耗リンパ球である免疫細胞の大部分を有する患者から患者まで有意に変化した。腫瘍細胞組成がPDACサブタイプを定義する重要な因子であることを見出した。さらに,EMT+癌細胞,活性化CAFsおよび内皮細胞に対する細胞型特異的マーカーの発現レベルは,患者生存と有意に関連していた。まとめると,著者らの研究は,PDAC腫瘍の細胞組成,および原発腫瘍と転移性病変の間の有意な不均一性を同定する。さらに,細胞組成はPDACサブタイプを定義する重要な因子であり,患者の転帰と有意に相関した。これらの知見はPDAC微小環境に関する貴重な洞察を提供し,PDAC患者の管理を潜在的に知らせる。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  相互作用 ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *間質組織 ,  *腫瘍 ,  腫瘍細胞 ,  リンパ球 ,  マクロファージ ,  生検 ,  内皮細胞 ,  固形腫瘍 ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 微小環境 ,  *単一細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 単一細胞RNA配列決定 ,  膵臓癌 ,  細胞不均一性 ,  膵臓癌サブタイプ

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  発癌機序・因子  (GE02020C)

引用文献 (44件)：

• Nat Rev Drug Discov; Tackling the cancer stem cells - what challenges do they pose?; DR Pattabiraman, RA Weinberg; 13; 7; 2014; 497-512; 10.1038/nrd4253; citation_id=CR1
• Crit Rev Oncog; Tumor-stromal interactions in pancreatic cancer; C Whatcott, H Han, RG Posner, DD Hoff; 18; 1-2; 2013; 135-151; 10.1615/CritRevOncog.v18.i1-2.80; citation_id=CR2
• Future Oncol; HALO-109-301: a phase III trial of PEGPH20 (with gemcitabine and nab-paclitaxel) in hyaluronic acid-high stage IV pancreatic cancer; GJ Doherty, M Tempero, PG Corrie; 14; 1; 2018; 13-22; 10.2217/fon-2017-0338; citation_id=CR3
• J Clin Oncol; HALO 202: randomized phase II study of PEGPH20 plus nab-paclitaxel/gemcitabine versus nab-paclitaxel/gemcitabine in patients with untreated, metastatic pancreatic ductal adenocarcinoma; SR Hingorani, L Zheng, AJ Bullock, TE Seery, WP Harris, DS Sigal; 36; 4; 2018; 359-366; 10.1200/JCO.2017.74.9564; citation_id=CR4
• Cancer Immunol Res; Can targeting stroma pave the way to enhanced antitumor immunity and immunotherapy of solid tumors?; E Pure, A Lo; 4; 4; 2016; 269-278; 10.1158/2326-6066.CIR-16-0011; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (9件)： 膵管腺癌 ,  原発腫瘍 ,  転移性 ,  病変 ,  腫瘍 ,  間質 ,  区画 ,  単一細胞 ,  トランスクリプトーム解析