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J-GLOBAL ID：202102245966173681   整理番号：21A0211658

ハロアルカンデハロゲナーゼファミリー内の表面ループ-ヘリックス移植の構造的および触媒効果【JST・京大機械翻訳】

Structural and catalytic effects of surface loop-helix transplantation within haloalkane dehalogenase family

著者 (8件)： Marek Martin (Loschmidt Laboratories, Department of Experimental Biology and RECETOX, Faculty of Science, Masaryk University, Kamenice 5, Bld. A13, 625 00 Brno, Czech Republic) ,  Chaloupkova Radka (Loschmidt Laboratories, Department of Experimental Biology and RECETOX, Faculty of Science, Masaryk University, Kamenice 5, Bld. A13, 625 00 Brno, Czech Republic) ,  Prudnikova Tatyana (Faculty of Science, University of South Bohemia in Ceske Budejovice, Branisovska 1760, 37005 Ceske Budejovice, Czech Republic) ,  Sato Yukari (Graduate School of Life Sciences, Tohoku University, 2-1-1 Katahira, 980-8577 Sendai, Japan) ,  Rezacova Pavlina (Institute of Molecular Genetics, Academy of Sciences of the Czech Republic, 142 20 Prague, Czech Republic) ,  Nagata Yuji (Graduate School of Life Sciences, Tohoku University, 2-1-1 Katahira, 980-8577 Sendai, Japan) ,  Kuta Smatanova Ivana (Faculty of Science, University of South Bohemia in Ceske Budejovice, Branisovska 1760, 37005 Ceske Budejovice, Czech Republic) ,  Damborsky Jiri (Loschmidt Laboratories, Department of Experimental Biology and RECETOX, Faculty of Science, Masaryk University, Kamenice 5, Bld. A13, 625 00 Brno, Czech Republic)
資料名： Computational and Structural Biotechnology Journal  (Computational and Structural Biotechnology Journal)
巻： 18  ページ： 1352-1362  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3522A  ISSN： 2001-0370  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： エンジニアリング酵素触媒特性は,基礎研究およびバイオテクノロジー応用に重要である。我々は以前,短い表面ループ要素の欠失を介した酵素アクセストンネルの再形成が,著しく修飾した基質特異性とエナンチオ選択性を有するハロアルカンデハロゲナーゼ変異体を生じることを示す。ここでは,ハロアルカンデハロゲナーゼの酵素ファミリー内の1つの酵素から別の酵素への表面ループ-ヘリックス移植の影響を逆に調べた。正確に,DbjAからDbeAの対応する部位へのL9ループとα4ヘリックスの9残基長延長を移植した。生物物理学的特性化は,このフラグメント移植が全体的な蛋白質折畳みまたはオリゴマ状態に影響しないが,蛋白質安定性(ΔT_m=-5~6°C)を低下させることを示した。興味深いことに,DbeA変異体の結晶構造は,この酵素ファミリーに対する触媒特性の決定因子である酵素アクセストンネルのユニークな構造的特徴を明らかにした。生化学的データは,挿入が種々のハロゲン化基質でDbeAの活性を増加させ,いくつかの直鎖β-ブロモアルカンでそのエナンチオ選択性を変化させることを確認した。著者らの知見は,修飾触媒特性を有する新規蛋白質触媒の構築のための表面ループ-ヘリックス移植を用いる蛋白質工学戦略を支持する。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結晶構造 ,  *酵素 ,  ハロゲン化 ,  基質 ,  基質特異性 ,  タンパク質 ,  オリゴマ ,  タンパク質工学
準シソーラス用語： 蛋白質折畳み ,  *触媒作用 ,  エナンチオ選択性 ,  *ハロアルカンデハロゲナーゼ ,  酵素触媒 ,  残基 ,  触媒特性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： ハロアルカンデハロゲナーゼ(HLD) ,  バイオ触媒 ,  ループ-ヘリックス移植 ,  X線結晶学 ,  エナンチオ選択性 ,  アクセストンネル ,  酵素工学 ,  蛋白質設計

分類 (2件)： 酵素の応用関連  (EB09100B) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (6件)： ハロアルカンデハロゲナーゼ ,  ファミリー ,  ループ ,  ヘリックス ,  移植 ,  触媒効果