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J-GLOBAL ID：202102248343275087   整理番号：21A2816423

Habu Snake,Protobothrops flavoviridisの多様な毒蛋白質の可能な産生の基礎となる3つの毒素ファミリーにおけるオルタナティブmRNAスプライシング【JST・京大機械翻訳】

Alternative mRNA Splicing in Three Venom Families Underlying a Possible Production of Divergent Venom Proteins of the Habu Snake, Protobothrops flavoviridis

著者 (13件)： Ogawa Tomohisa (Department of Molecular and Chemical Life Science, Graduate School of Life Sciences, Tohoku University, Sendai, Miyagi 980-8577, Japan) ,  Oda-Ueda Naoko (Department of Pharmaceutical Sciences, Faculty of Pharmaceutical Sciences, Sojo University, Kumamoto 860-0082, Japan) ,  Hisata Kanako (Marine Genomics Unit, Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University, Onna, Okinawa 904-0495, Japan) ,  Nakamura Hitomi (Department of Pharmaceutical Sciences, Faculty of Pharmaceutical Sciences, Sojo University, Kumamoto 860-0082, Japan) ,  Chijiwa Takahito (Department of Applied Life Science, Faculty of Bioscience and Biotechnology, Sojo University, Kumamoto 860-0082, Japan) ,  Hattori Shousaku (Institute of Medical Science, University of Tokyo, Oshima-gun, Kagoshima 894-1531, Japan) ,  Isomoto Akiko (Division of Genomics, Medical Institute of Bioregulation, Kyushu University, Fukuoka 812-8582, Japan) ,  Yugeta Haruki (Department of Molecular and Chemical Life Science, Graduate School of Life Sciences, Tohoku University, Sendai, Miyagi 980-8577, Japan) ,  Yamasaki Shinichi (DNA Sequencing Section, Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University, Onna, Okinawa 904-0495, Japan.) ,  Fukumaki Yasuyuki (Division of Genomics, Medical Institute of Bioregulation, Kyushu University, Fukuoka 812-8582, Japan) ,  Ohno Motonori (Department of Applied Life Science, Faculty of Bioscience and Biotechnology, Sojo University, Kumamoto 860-0082, Japan) ,  Satoh Noriyuki (Marine Genomics Unit, Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University, Onna, Okinawa 904-0495, Japan) ,  Shibata Hiroki (Division of Genomics, Medical Institute of Bioregulation, Kyushu University, Fukuoka 812-8582, Japan)
資料名： Toxins (Web)  (Toxins (Web))
巻： 11  号： 10  ページ： 581  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7286A  ISSN： 2072-6651  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： スネーク毒は種々の遺伝子ファミリーによりコードされる毒性蛋白質の複雑な混合物であり,これは,カパシテート餌に相乗的に機能する。ヘビ毒遺伝子および蛋白質の巨大なレパートリーが報告されており,代替スプライシングが分岐遺伝子転写物の産生に関与することが示唆されている。しかし,転写レパートリーのゲノムワイド調査とオルタナティブスプライシングの程度はまだ決定されていない。本研究では,PacBio配列決定を用いて,毒腺におけるトランスクリプトームの包括的解析を行った。広範な選択的スプライシングを,3つの毒蛋白質遺伝子ファミリー,メタロプロテイナーゼ(MP),セリンプロテアーゼ(SP),および血管内皮増殖因子(VEGF)で観察した。11のMPとSP遺伝子とVEGF遺伝子は,それぞれ合計81,61と8の転写産物変異体として発現した。MP遺伝子ファミリーにおいて,個々の遺伝子は選択的スプライシングにより異なるクラスのMPに転写される。クラスター化SP遺伝子間のトランススプライシングも観察した。他の毒遺伝子だけでなく,非venom対照遺伝子も選択的スプライシングを示さなかった。これらの結果から,habuヘビにおける毒遺伝子の高可変転写物の産生におけるmRNA代替及びトランススプライシングの潜在的寄与を示した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *mRNA ,  遺伝子 ,  蛇毒 ,  *タンパク質 ,  *毒素 ,  クラスタ化 ,  毒腺 ,  セリンプロテイナーゼ ,  メタロプロテイナーゼ ,  選択的スプライシング ,  VEGF ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： トランススプライシング ,  転写産物 ,  遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 毒素遺伝子と蛋白質 ,  メタロプロテイナーゼ ,  セリンプロテアーゼ ,  血管内皮細胞増殖因子 ,  トランスクリプトーム変異体

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (40件)：

• Fry, B.G.; Vidal, N.; Norman, J.A.; Vonk, F.J.; Scheib, H.; Ramjan, S.F.R.; Kuruppu, S.; Fung, K.; Hedges, S.B.; Richardson, M.K.; et al. Early evolution of the venom system in lizards and snakes. Nature 2006, 439, 584-588.
• Fry, B.G.; Vidal, N.; Van Der Weerd, L.; Kochva, E.; Renjifo, C. Evolution and diversification of the Toxicofera reptile venom system. J. Proteom. 2009, 72, 127-136.
• Ikeda, N.; Chijiwa, T.; Matsubara, K.; Oda-Ueda, N.; Hattori, S.; Matsuda, Y.; Ohno, M. Unique structural characteristics and evolution of a cluster of venom phospholipase A2 isozyme genes of Protobothrops flavoviridis snake. Gene 2010, 461, 15-25.
• Castoe, T.A.; Hall, K.T.; Mboulas, M.L.G.; Gu, W.; De Koning, A.J.; Fox, S.E.; Poole, A.W.; Vemulapalli, V.; Daza, J.M.; Mockler, T.; et al. Discovery of highly divergent repeat landscapes in snake genomes using high-throughput sequencing. Genome Biol. Evol. 2011, 3, 641-653.
• Aird, S.D.; Watanabe, Y.; Villar-Briones, A.; Roy, M.C.; Terada, K.; Mikheyev, A.S. Quantitative high-throughput profiling of snake venom gland transcriptomes and proteomes (Ovophis okinavensis and Protobothrops flavoviridis). BMC Genom. 2013, 14, 790.

タイトルに関連する用語 (7件)： 毒 ,  蛋白質 ,  基礎 ,  毒素 ,  ファミリー ,  オルタナティブ ,  mRNAスプライシング