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J-GLOBAL ID：202102249569775770   整理番号：21A0519026

ザクロのトランスクリプトームプロファイリングは塩耐性への洞察を提供する【JST・京大機械翻訳】

Transcriptomic Profiling of Pomegranate Provides Insights into Salt Tolerance

著者 (11件)： Liu Cuiyu (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Liu Cuiyu (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Zhao Yujie (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Zhao Yujie (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Zhao Xueqing (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Zhao Xueqing (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Wang Jinping (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Wang Jinping (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Gu Mengmeng (Department of Horticultural Sciences, Texas A&M AgriLife Extension Service, College Station, TX 77843-2134, USA) ,  Yuan Zhaohe (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Yuan Zhaohe (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China)
資料名： Agronomy (Web)  (Agronomy (Web))
巻： 10  号： 1  ページ： 44  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7129A  ISSN： 2073-4395  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ザクロ(Punica granatum L.)は,乾燥および半乾燥土壌で,一定の土壌塩類化によって広く成長している。mRNAレベルに対する塩ストレスに対する分子応答を解明するために,200mM NaCl処理後0(対照),3および6日後のザクロ根および葉の18のcDNAライブラリーを構築した。全体で,ゲノムへのマッピングによって34,047の遺伝子を得て,次に,1080の上方制御された遺伝子と1175の下方制御された遺伝子を含む2255のDEG(差別的に発現された遺伝子)を同定した。ほとんどのDEGの発現パターンは組織特異的で時間特異的であることを見出した。根DEGの中で,細胞壁組織化と膜貫通輸送に関連する遺伝子は抑制され,ほとんどの代謝関連遺伝子は過剰発現した。葉では,DEGの41.29%が最初に抑制され,イオン/金属イオン結合関連遺伝子を含む回復した。また,イオン輸送と酸化-還元プロセスは制限された。ABA,Ca2+関連及びMAPKシグナル伝達経路に関与する多くのDEG,例えばABA受容体,Ca2+センサ,MAPKカスケード,TF及びHSPs,LEA,AQP及びPODをコードする下流機能遺伝子を見出した。15の遺伝子を選択し,qRT-PCRを用いてRNA-seqデータを確認した。本研究は,塩分に対するザクロ分子応答を明らかにするだけでなく,ザクロ育種プロセスにおける耐塩性遺伝子選択のための参照を提供した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 塩化ナトリウム ,  mRNA ,  遺伝子 ,  細胞壁 ,  塩分 ,  育種 ,  金属イオン ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 塩分ストレス ,  *ザクロ ,  cDNAライブラリー ,  過剰発現 ,  RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ザクロ ,  塩ストレス ,  トランスクリプトーム ,  組織特異性 ,  情報伝達経路 ,  転写因子

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物生理学一般  (EH02010Y)

引用文献 (62件)：

• Li, J.; Pu, L.; Zhu, M.; Zhang, R. The present situation and hot issues in the salt-affected soil research. Acta Geogr. Sin. 2012, 67, 1233-1245.
• Zhu, J.K. Plant salt tolerance. Trends Plant Sci. 2001, 6, 66-71.
• Pandey, P.; Ramegowda, V.; Senthil-Kumar, M. Shared and unique responses of plants to multiple individual stresses and stress combinations: Physiological and molecular mechanisms. Front. Plant Sci. 2015, 6, 723.
• Munns, R.; Tester, M. Mechanisms of salinity tolerance. Annu. Rev. Plant Biol. 2008, 59, 651-681.
• Zhang, H.; Han, B.; Wang, T.; Chen, S.; Li, H.; Zhang, Y.; Dai, S. Mechanisms of plant salt response: Insights from proteomics. J. Proteome Res. 2011, 11, 49-67.

タイトルに関連する用語 (3件)： ザクロ ,  塩耐性 ,  洞察