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J-GLOBAL ID：202102253403182360   整理番号：21A0015168

GWASの要約統計を用いた冠動脈疾患と慢性腎臓病における潜在的菌血症遺伝子の検出の改善【JST・京大機械翻訳】

Improved Detection of Potentially Pleiotropic Genes in Coronary Artery Disease and Chronic Kidney Disease Using GWAS Summary Statistics

著者 (7件)： Chen Haimiao (Department of Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Xuzhou Medical University, Xuzhou, China) ,  Wang Ting (Department of Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Xuzhou Medical University, Xuzhou, China) ,  Yang Jinna (Department of Infectious Diseases, People’s Hospital of Zhuji, Shaoxing, China) ,  Huang Shuiping (Department of Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Xuzhou Medical University, Xuzhou, China) ,  Huang Shuiping (Center for Medical Statistics and Data Analysis, School of Public Health, Xuzhou Medical University, Xuzhou, China) ,  Zeng Ping (Department of Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Xuzhou Medical University, Xuzhou, China) ,  Zeng Ping (Center for Medical Statistics and Data Analysis, School of Public Health, Xuzhou Medical University, Xuzhou, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 11  ページ： 592461  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 冠動脈疾患(CAD)と慢性腎臓病(CKD)の共存は重複した遺伝的基礎を意味する。しかし,2つの疾患の間の一般的な遺伝的決定は,ほとんど未知のままである。大規模ゲノムワイド関連研究(CADに対するn=184,305,CKDに対するn=567,460)から利用可能な要約統計量に基づいて,著者らは,連鎖不平衡スコア回帰を介してCADとCKD(r_g=0.173,p=0.024)の間の有意な陽性遺伝相関を観察した。次に,MAGMA(GenoMic Annotationのマルチマーカー分析)を介して各疾患に対する遺伝子ベースの関連分析を行い,CADまたはCKD(FDR<0.05)に関連する763および827の遺伝子を検出した。それらの72の遺伝子が2つの疾患の間で共有された。さらに,CADとCKDの間の重複した遺伝的情報を統合することにより,cFDR(条件的偽発見率)とGPA(PleiotrophyとAnnotationを取り入れた遺伝分析)を含む2つのpleiotrophy-informed Informationalアプローチを実装し,そのうち121の遺伝子がcFDRとGPAによって同時に発見された169と504の共有遺伝子(FDR)を同定した。重要なことに,CADとCKDの両方に関連した11の潜在的に新しい多面的遺伝子(すなわち,ARHGEF19,RSG1,NDST2,CAMK2G,VCL,LRP10,RBM23,USP10,WNT9B,GOSR2,およびRPRML)を見出した。新たに同定された多面的遺伝子の5つをUK Biobankから利用可能な付加的データセットCADによりさらに繰り返した。機能的濃縮分析は,これらの多面的遺伝子が,四級アンモニウム基膜貫通輸送体,ドーパミン輸送を含む多様な関連経路過程に富んでいることを示した。全体として,本研究はCADとCKDの間に重複した共通の遺伝的構造を同定し,2つの疾患の共存の根底にある分子機構の理解を進めるのに役立つであろう。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  *遺伝子 ,  菌血症 ,  統計量 ,  第四アンモニウム ,  *冠動脈疾患 ,  遺伝相関 ,  *ゲノムワイド関連解析 ,  *慢性腎臓病 ,  カテコールアミン ,  第一アミン
準シソーラス用語： 連鎖不平衡 ,  遺伝的構造 ,  輸送体 ,  分子機構 ,  遺伝子解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 冠動脈疾患 ,  慢性腎臓病 ,  多面的な統合解析 ,  遺伝子に基づく関連解析 ,  多面的遺伝子 ,  ゲノムワイド関連研究

分類 (2件)： 循環系の基礎医学  (GJ01020K) ,  遺伝的変異  (EC01030Y)

物質索引 (1件)： ドーパミン

引用文献 (78件)：

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• AndreassenO. A.DjurovicS.ThompsonW. K.SchorkA. J.KendlerK. S.O’DonovanM. C. (2013). Improved detection of common variants associated with schizophrenia by leveraging pleiotropy with cardiovascular-disease risk factors. Am. J. Hum. Genet. 92 197-209. doi: 10.1016/j.ajhg.2013.01.001 23375658
• BaigentC.LandrayM. J.ReithC.EmbersonJ.WheelerD. C.TomsonC. (2011). The effects of lowering LDL cholesterol with simvastatin plus ezetimibe in patients with chronic kidney disease (Study of Heart and Renal Protection): a randomised placebo-controlled trial. Lancet 377 2181-2192. doi: 10.1016/S0140-6736(11)60739-3

タイトルに関連する用語 (6件)： GWAS ,  統計 ,  冠動脈疾患 ,  慢性腎臓病 ,  菌血症 ,  遺伝子