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J-GLOBAL ID：202102254486072484   整理番号：21A0015625

古い海綿動物試料から期待される以上のもの:Nha Trang湾(ベトナム)における海洋魚類多様性の自然サンプラDNAメタバーコーディング評価【JST・京大機械翻訳】

More Than Expected From Old Sponge Samples: A Natural Sampler DNA Metabarcoding Assessment of Marine Fish Diversity in Nha Trang Bay (Vietnam)

著者 (5件)： Turon Marta (Norwegian College of Fishery Science (NFH), UiT The Arctic University of Norway, Tromso, Norway) ,  Angulo-Preckler Carlos (Norwegian College of Fishery Science (NFH), UiT The Arctic University of Norway, Tromso, Norway) ,  Antich Adria (Centre d’Estudis Avancats de Blanes-Centro Superior de Investigaciones Cientificas (CEAB-CSIC), Girona, Spain) ,  Praebel Kim (Norwegian College of Fishery Science (NFH), UiT The Arctic University of Norway, Tromso, Norway) ,  Wangensteen Owen S. (Norwegian College of Fishery Science (NFH), UiT The Arctic University of Norway, Tromso, Norway)
資料名： Frontiers in Marine Science (Web)  (Frontiers in Marine Science (Web))
巻： 7  ページ： 605148  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7076A  ISSN： 2296-7745  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： スポンジは,ろ過水におけるそれらの効率により環境DNAのための天然サンプラとして作用する理想的な候補として最近提案された。しかし,海綿から回収したDNAの有用性の検証は,海洋保護Areasにおける脊椎動物の生物多様性パターンを明らかにする必要がある。さらに,異なるスポンジ種と形態が環境DNAの捕獲にどのように影響するかについて知られておらず,スポンジから得られた生物多様性パターンが定量的または定性的尺度によって最もよく記述されるかどうかについて知られていない。本研究では,魚類由来のメタバーコード環境DNAに対するユニバーサルPCRプライマー(MiFish)のセットを用いて脊椎動物特異的12Sバーコードを増幅し,配列決定し,Nha Trang湾(中央ベトナム)における富栄養および良く保存されたサンゴ礁に位置する64の海綿(16種)から回収した天然標本DNAからの魚類群集の微細スケールパターンを明らかにした。90の熱帯魚種が海綿から同定され,これは以前の広範な従来の調査から報告された全局所魚鱗動物の1/3に相当する。富栄養化と良く保存された環境の間の魚類コミュニティにおける顕著な分化が観察されたが,富栄養化は魚類コミュニティ間の変動の適度な割合を説明した。海綿種または形態間の魚類環境DNA捕獲の効率の違いは,観察されなかった。全体として,検出された魚種の大部分は珊瑚礁環境において予測されるように,礁関連小サイズ種に対応した。注目すべきことに,海綿組織から遠洋性,移動性および深海魚種も回収され,スポンジがサンプリングされたバイオームと恒久的に関連しない魚類を検出するためのスポンジ天然サンプリングDNAの能力を指摘した。これらの結果は,超多様な環境における脊椎動物の多様性を評価するための費用対効果の高い方法として,天然サンプラの適合性を強調する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *動物 ,  *DNA【核酸】 ,  脊椎動物 ,  富栄養化 ,  *海綿動物 ,  珊瑚礁 ,  *海洋 ,  捕獲 ,  熱帯魚 ,  生物群系 ,  魚群 ,  バーコード ,  生物多様性 ,  礁
準シソーラス用語： 費用対効果 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 自然試料採取器 ,  環境DNA ,  スポンジ ,  魚類の多様性 ,  サンゴ礁

分類 (2件)： 動物分類学  (EJ01030T) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

引用文献 (47件)：

• BakkerJ.WangensteenO. S.BaillieC.BuddoD.ChapmanD. D.GallagherA. J. (2019). Biodiversity assessment of tropical shelf eukaryotic communities via pelagic eDNA metabarcoding. Ecol. Evol. 9 14341-14355. doi: 10.1002/ece3.5871 31938523
• BoussarieG.BakkerJ.WangensteenO. S.MarianiS.BonninL.JuhelJ.-B. (2018). Environmental DNA illuminates the dark diversity of sharks. Sci. Adv. 4:eaa9661. doi: 10.1126/sciadv.aap9661 29732403
• BoyerF.MercierC.BoninA.Le BrasY.TaberletP.CoissacE. (2016). obitools: a unix -inspired software package for DNA metabarcoding. Mol. Ecol. Resour. 16 176-182. doi: 10.1111/1755-0998.12428 25959493
• CollinsR. A.BakkerJ.WangensteenO. S.SotoA. Z.CorriganL.SimsD. W. (2019). Non-specific amplification compromises environmental DNA metabarcoding with COI. Methods Ecol. Evol. 10 1985-2001. doi: 10.1111/2041-210X.13276
• CreerS.DeinerK.FreyS.PorazinskaD.TaberletP.ThomasW. K. (2016). The ecologist’s field guide to sequence-based identification of biodiversity. Methods Ecol. Evol. 7 1008-1018. doi: 10.1111/2041-210X.12574

タイトルに関連する用語 (11件)： 海綿動物 ,  試料 ,  期待 ,  ベトナム ,  海洋 ,  魚類 ,  多様性 ,  サンプラ ,  DNA ,  メタバーコーディング ,  評価