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J-GLOBAL ID：202102257031675118   整理番号：21A0097128

SARS-CoV2における地理的多様性の進化と複製酵素3CLのin silico解析は再目的薬物候補を標的とする【JST・京大機械翻訳】

Evolving geographic diversity in SARS-CoV2 and in silico analysis of replicating enzyme 3CL pro targeting repurposed drug candidates

著者 (13件)： Chitranshi Nitin (Faculty of Medicine, Health and Human Sciences, Macquarie University, North Ryde, Australia) ,  Gupta Vivek K. (Faculty of Medicine, Health and Human Sciences, Macquarie University, North Ryde, Australia) ,  Rajput Rashi (Faculty of Medicine, Health and Human Sciences, Macquarie University, North Ryde, Australia) ,  Godinez Angela (Faculty of Medicine, Health and Human Sciences, Macquarie University, North Ryde, Australia) ,  Pushpitha Kanishka (Faculty of Medicine, Health and Human Sciences, Macquarie University, North Ryde, Australia) ,  Shen Ting (Faculty of Medicine, Health and Human Sciences, Macquarie University, North Ryde, Australia) ,  Mirzaei Mehdi (Faculty of Medicine, Health and Human Sciences, Macquarie University, North Ryde, Australia) ,  Mirzaei Mehdi (Australian Proteome Analysis Facility, Macquarie University, North Ryde, Australia) ,  You Yuyi (Faculty of Medicine, Health and Human Sciences, Macquarie University, North Ryde, Australia) ,  Basavarajappa Devaraj (Faculty of Medicine, Health and Human Sciences, Macquarie University, North Ryde, Australia) ,  Gupta Veer (School of Medicine, Deakin University, Melbourne, Australia) ,  Graham Stuart L. (Faculty of Medicine, Health and Human Sciences, Macquarie University, North Ryde, Australia) ,  Graham Stuart L. (Save Sight Institute, Sydney University, Sydney, Australia)
資料名： Journal of Translational Medicine (Web)  (Journal of Translational Medicine (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 1-15  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7330A  ISSN： 1479-5876  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 重症急性呼吸器症候群(SARS)は,世紀の始め以来,流行を始めている。2019年12月に,世界は世界的にほぼ4百万の個人に感染する壊滅的SARSエピソードによって再びヒットされ,2020年中頃から既に発生した20万人以上の死亡者があり,感染率は指数的に成長し続けている。SARSコロナウイルス2(SARS-CoV-2)は,高変異率を特徴とする一本鎖RNA病原体である。SARS-CoV-2が1つの宿主免疫からもう1つに急速にジャンプし,局所集団の遺伝子プールに適応するウイルスゲノムの変異原性能を探索することは極めて重要である。本研究では,SARS-CoV-2感染患者から報告された2301の完全ウイルス配列を分析した。SARS-CoV-2宿主ゲノムを,pangolin-CoV起源由来の9つのゲノムとコウモリ-CoV起源の3つのゲノムを含む全インフルエンザデータ(GISAID)データベースのグローバルイニシアティブから収集して,武漢SARS-CoV2参照ゲノムをGeneBankデータベースから採取した。多重配列アラインメントツール,Clustal Omegaをゲノム配列アラインメントに用いた。ウイルス複製酵素,3-キモトリプシン様システインプロテアーゼ(3CLpro)は,その病原性において重要な役割を担っているが,薬理学的阻害剤との親和性および抗ウイルスフラボン,ビフラバノイド,抗マラリア薬およびビタミンサプリメントなどの目的薬物との親和性を評価するために使用された。著者らの結果は,コウモリ-CoVが>96%の類似同一性を共有し,一方,パンゴリン-CoVは武漢SARS-CoV-2ゲノムと85.98%の同一性を共有することを示した。この詳細な分析は,南アメリカで3が独特で,アフリカで4つのユニークなアフリカウイルスゲノムとアフリカウイルスゲノムにおける12の新規再発変異を同定し,そして5つは両方の集団から入院患者分離株を示した。in silicoアプローチの最先端を用いて,本研究はさらに,ウイルス複製機構を調節するSARS-CoV-23CLpro酵素と再目的薬物の相互作用を調べた。全体として,本研究は,ウイルス病原性の理解と,nCovid-19パンデミックと戦うための化合物の再精製のための可能な新しい戦略の理解に,進化する変異への洞察を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  データベース ,  *酵素 ,  抗マラリア薬 ,  死 ,  ゲノム ,  病原性 ,  ウイルス複製 ,  親和性 ,  病原体 ,  コウモリ ,  サプリメント
準シソーラス用語： *重症急性呼吸器症候群 ,  ウイルスゲノム ,  *in silico , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

引用文献 (66件)：

• Euro Surveill; Note from the editors: World Health Organization declares novel coronavirus (2019-nCoV) sixth public health emergency of international concern; T Eurosurveillance Editorial; 25; 2020; 200131e; citation_id=CR1
• Nat Microbiol; The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2; ; 5; 2020; 536-544; citation_id=CR2
• J Thorac Dis; From SARS coronavirus to novel animal and human coronaviruses; KK To, IF Hung, JF Chan, KY Yuen; 5; Suppl 2; 2013; S103-S108; citation_id=CR3
• J Med Chem; An overview of severe acute respiratory syndrome-coronavirus (SARS-CoV) 3CL protease inhibitors: peptidomimetics and small molecule chemotherapy; T Pillaiyar, M Manickam, V Namasivayam, Y Hayashi, SH Jung; 59; 2016; 6595-6628; citation_id=CR4
• Ocul Immunol Inflamm; Can the coronavirus disease 2019 (COVID-19) affect the eyes? A review of coronaviruses and ocular implications in humans and animals; I Seah, R Agrawal; 28; 2020; 391-395; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (8件)： 地理 ,  多様性 ,  進化 ,  複製 ,  酵素 ,  解析 ,  薬物 ,  標的