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J-GLOBAL ID:202102257217481752   整理番号:21A0083395

PEDtracker:Drosophila melanogaster幼生に対する自動病期分類アプローチ【JST・京大機械翻訳】

The PEDtracker: An Automatic Staging Approach for Drosophila melanogaster Larvae
著者 (2件):
資料名:
巻: 14  ページ: 612313  発行年: 2020年 
JST資料番号: U7035A  ISSN: 1662-5153  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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甲殻類と昆虫を含む節足動物種の胚発生は,脱皮または脱皮によって特性化される。この過程は成長段階を定義し,保存された神経内分泌系によって制御される。各脱皮事象は,プレモルト,モルト,およびポストモルトのようないくつかの臨界時点に分割され,それらのクチクラは再硬化する間,一時的に高度に脆弱な状態で動物を葉にする。脱皮事象は,発生中の特定の時間窓内の即時脱皮配列で生じる。各サブステージは,通常,数分の1の短い時間のみを取る。これらの比較的短い行動事象を見つけるためには,数日間にわたって全胚後発達を追跡する必要がある。脱皮配列の手動検出は時間がかかり,誤差がかかるので,ショウジョウバエDrosophila melanogasterの胚後発育の連続観察を容易にするモニタリングシステムを設計した。一定の環境条件下で,この種において約10日かかる胚状態から成虫までのライフサイクルを観察することができた。FijiとRで開発した特定の処理アルゴリズムは,卵の孵化,脱皮と蛹化を含む個々のレベルに関するユニークな行動事象の決定を可能にする。さらに,個体幼虫の成長速度と活性パターンを測定した。新しく作成したRPackage PEDtrackerは,重要な発生事象を予測し,幼虫発達の様々な側面の変化を同定する自動化スクリーンを実行する可能性を提供する。結論として,本研究で提示したPEDトラックシステムは,節足動物開発だけでなく,自動化リアルタイムステージングと分析の基礎を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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, 【Automatic Indexing@JST】
分類 (3件):
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精神科の基礎医学  ,  個生態学  ,  心理学一般 
引用文献 (57件):
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