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J-GLOBAL ID：202102258711219617   整理番号：21A0095883

Pol I,Pol IIおよびPol IIIの消失後のクロマチン相互作用の全ゲノム解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide analyses of chromatin interactions after the loss of Pol I, Pol II, and Pol III

著者 (13件)： Jiang Yongpeng (Key Laboratory of Cell Proliferation and Differentiation of the Ministry of Education, School of Life Sciences, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Huang Jie (Key Laboratory of Cell Proliferation and Differentiation of the Ministry of Education, School of Life Sciences, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Lun Kehuan (Key Laboratory of Cell Proliferation and Differentiation of the Ministry of Education, School of Life Sciences, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Li Boyuan (Key Laboratory of Cell Proliferation and Differentiation of the Ministry of Education, School of Life Sciences, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Zheng Haonan (Key Laboratory of Cell Proliferation and Differentiation of the Ministry of Education, School of Life Sciences, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Li Yuanjun (Key Laboratory of Cell Proliferation and Differentiation of the Ministry of Education, School of Life Sciences, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Zhou Rong (Key Laboratory of Cell Proliferation and Differentiation of the Ministry of Education, School of Life Sciences, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Duan Wenjia (Key Laboratory of Cell Proliferation and Differentiation of the Ministry of Education, School of Life Sciences, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Wang Chenlu (Key Laboratory of Cell Proliferation and Differentiation of the Ministry of Education, School of Life Sciences, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Feng Yuanqing (Key Laboratory of Cell Proliferation and Differentiation of the Ministry of Education, School of Life Sciences, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Yao Hong (Key Laboratory of Cell Proliferation and Differentiation of the Ministry of Education, School of Life Sciences, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Li Cheng (Academy for Advanced Interdisciplinary Studies, School of Life Sciences, Center for Statistical Science, Center for Bioinformatics, Peking University, Beijing, China) ,  Ji Xiong (Key Laboratory of Cell Proliferation and Differentiation of the Ministry of Education, School of Life Sciences, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Peking University, Beijing, China)
資料名： Genome Biology (Web)  (Genome Biology (Web))
巻： 21  号： 1  ページ： 1-28  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7384A  ISSN： 1474-760X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 転写と3Dクロマチン構造の間の関係は議論されている。多重研究は,転写が全体的コヒーシン結合と3Dゲノム構造に影響することを示した。しかし,いくつかの他の研究は,転写阻害がクロマチン立体配座を変化させないことを示した。転写が哺乳類細胞における局所,小規模クロマチン構造を組織化するのに比較的穏やかな役割を演ずることを,今日まで最も包括的な証拠を示した。mESCsにおけるPol I,Pol IIおよびPol III蛋白質の分解は,大規模3Dクロマチン構造においてほとんど変化または全く変化せず,高存在量の結合部位または活性プロモーター関連相互作用を有する選択されたRNAポリメラーゼは,分解後に比較的影響を受けるように思われ,転写阻害は,高分解能クロマチン相互作用マップにより示されるように,また,結合Pol IIとのループは,転写阻害後,ほとんど変化しないが,CohesinまたはCTCFは同定されず,そして,結合Pol IIを有するループは,同定され,そして,転写阻害後には,ほとんど変化しないことを見出した。興味深いことに,より長い時間に対するPol II枯渇はクロマチン接近性及びコヘシン占有に有意に影響し,RNAポリメラーゼが間接的に3Dゲノムに影響することを示唆した。これらの直接的および間接的効果は,3Dゲノムに対する転写阻害の影響に関する以前の矛盾した知見を説明する。Pol I,Pol II及びPol III欠失は哺乳類細胞における局所,小規模クロマチン相互作用を変化させ,3Dクロマチン構造が予め確立され,比較的安定であることを示唆した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *相互作用 ,  立体配座 ,  RNAポリメラーゼ ,  *クロマチン ,  タンパク質 ,  *ゲノム ,  結合部位 ,  プロモーター領域 ,  三次元 ,  高分解能
準シソーラス用語： コヒーシン ,  哺乳類細胞 ,  クロマチン構造 ,  *全ゲノム解析 ,  転写阻害 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： RNAポリメラーゼ ,  3Dクロマチン構成 ,  転写

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (93件)：

• Annu Rev Cell Dev Biol; The three-dimensional organization of mammalian genomes; M Yu, B Ren; 33; 2017; 265-289; citation_id=CR1
• Cell; The 3D genome as moderator of chromosomal communication; J Dekker, L Mirny; 164; 2016; 1110-1121; citation_id=CR2
• Nat Rev Genet; Organizational principles of 3D genome architecture; MJ Rowley, VG Corces; 19; 2018; 789-800; citation_id=CR3
• Nat Rev Genet; Long-range enhancer-promoter contacts in gene expression control; S Schoenfelder, P Fraser; 20; 2019; 437-455; citation_id=CR4
• Mol Cell; Regulatory landscaping: how enhancer-promoter communication is sculpted in 3D; MI Robson, AR Ringel, S Mundlos; 74; 2019; 1110-1122; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (3件)： クロマチン ,  相互作用 ,  全ゲノム解析