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J-GLOBAL ID：202102261897528885   整理番号：21A0167712

α-ヘリックス折畳みのための天然ベース散逸粒子動力学アプローチ【JST・京大機械翻訳】

Native-Based Dissipative Particle Dynamics Approach for α-Helical Folding

著者 (2件)： Choudhury Chandan Kumar (Department of Materials Science and Engineering, Clemson University, South Carolina, United States) ,  Kuksenok Olga (Department of Materials Science and Engineering, Clemson University, South Carolina, United States)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 124  号： 50  ページ： 11379-11386  発行年： 2020年 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 安定な螺旋立体配座へのポリアラニン折畳みを捕捉する散逸粒子動力学(DPD)法を開発した。提案したネイティブベース手法の中で,分子動力学(MD)シミュレーションから構築した接触マップに基づいてDPDパラメータを導いた。提案アプローチは,十分に長いポリペプチドに対する束形成を含む,種々の長さのポリペプチドの折畳みを再現することを示した。提案した手法はまた,リゾチームの螺旋セグメントの折畳みを捉えることを可能にした。折畳みのための計算的に効率的な天然ベースDPDアプローチのさらなる開発により,αヘリックスセグメントを組み込んだ一連の生体材料のモデリングは,分子動力学シミュレーションでアクセスできるものを超えて,時間と長さ尺度に拡張できた。Copyright 2021 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： シミュレーション ,  立体配座 ,  計算機シミュレーション ,  ポリペプチド ,  リゾチーム ,  *折畳み ,  ポリアラニン ,  分子動力学
準シソーラス用語： 生体材料 ,  αヘリックス ,  分子動力学シミュレーション ,  散逸粒子動力学 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (3件)： ヘリックス ,  折畳み ,  散逸粒子動力学