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J-GLOBAL ID：202102261965452247   整理番号：21A0017640

ヘーゼルにおけるハイスループットシークエンシングを用いた胚珠発生を調節する重要な候補マイクロRNA/mRNA対の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of vital candidate microRNA/mRNA pairs regulating ovule development using high-throughput sequencing in hazel

著者 (5件)： Liu Jianfeng (Jilin Provincial Key Laboratory of Plant Resource Science and Green Production, Jilin Normal University, Siping, PR China) ,  Luo Qizheng (Jilin Provincial Key Laboratory of Plant Resource Science and Green Production, Jilin Normal University, Siping, PR China) ,  Zhang Xingzheng (Jilin Provincial Key Laboratory of Plant Resource Science and Green Production, Jilin Normal University, Siping, PR China) ,  Zhang Qiang (Jilin Provincial Key Laboratory of Plant Resource Science and Green Production, Jilin Normal University, Siping, PR China) ,  Cheng Yunqing (Jilin Provincial Key Laboratory of Plant Resource Science and Green Production, Jilin Normal University, Siping, PR China)
資料名： BMC Developmental Biology (Web)  (BMC Developmental Biology (Web))
巻： 20  号： 1  ページ： 1-15  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7364A  ISSN： 1471-213X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Hazels(Corylus spp.)は,胚珠発生が種子塊性を決定する経済的に重要なナッツ生産種であり,ナット品質,マイクロRNA(miRNAs)を反映する重要なパラメーターの1つが,RNAサイレンシングと遺伝子発現の転写後調節に重要な役割を果たす。しかし,胚珠の成長と発育の調節に関与するmiRNAに関しては,現在ほとんど知られていない。本研究では,ヘイズにおける胚珠発生と成長に関与する重要なmiRNAの決定を試みた。4つの発育段階,すなわち胚珠形成(Ov1),初期胚珠成長(Ov2),急速胚珠成長(Ov3)および胚珠成熟(Ov4)における胚珠を調べた。Illumina配列決定プラットフォームを用いた小RNAとmRNA配列決定に基づいて,ヘイズにおける970miRNAを同定し,その内の766と204はそれぞれ既知と新規miRNAであった。Ov1-vs-Ov2,Ov1-vs-Ov3,Ov1-vs-Ov4,Ov2-vs-Ov3,Ov2-vs-Ov4,およびOv3-vs-Ov4対比較で,471の差次的発現マイクロRNA(DEmiRNA)とそれらの3117の標的特異的発現メッセンジャーRNA(DEmRNA)は,各DEmiRNAで11,199DEmiRNA/DEmRNA対を形成し,平均6.62の標的mRNAの発現を変化させた。すべてのDEmRNAの遺伝子およびゲノム(KEGG)濃縮分析の京都エンシクロペディアは,蛋白質輸出(ko03060),脂肪酸伸長(ko00062),澱粉およびショ糖代謝(ko00500),脂肪酸生合成(ko00061)およびアミノ糖およびヌクレオチド糖代謝(ko00520)を含む6対比較において29の有意に豊富なKEGG経路を明らかにした。著者らの結果は,逆変化傾向を示すDEmiRNA/DEmRNA対がストレス耐性,胚および種子発育,細胞増殖,オーキシン形質導入,および蛋白質,澱粉および脂肪の生合成に関連し,胚珠の成長と発育に関与することを示した。これらの知見は転写後調節レベルでの胚珠発生のより良い理解に寄与し,ヘーゼルナッツ胚珠の成長と発育のさらなる機能解析の基礎を築く。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生合成 ,  *mRNA ,  遺伝子 ,  オーキシン ,  タンパク質 ,  澱粉 ,  糖質代謝 ,  細胞増殖 ,  機能分析 ,  成長段階 ,  遺伝子発現 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *マイクロRNA ,  *胚珠 ,  低分子RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： マイクロRNA ,  mRNA ,  トランスクリプトーム ,  胚珠 ,  開発 ,  ヘーゼル

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (69件)：

• J Agr Food Chem; Effects of roasting on hazelnut lipids; JS Amaral, S Casal, RM Seabra, BPP Oliveira; 54; 2006; 1315-1321; 10.1021/jf052287v; citation_id=CR1
• Plant Reprod; Pistillate flower development and pollen tube growth mode during the delayed fertilization stage in Corylus heterophylla Fisch; JF Liu, HD Zhang, YQ Cheng, S Kafkas, M Güney; 27; 2014; 145-152; 10.1007/s00497-014-0248-9; citation_id=CR2
• Front Plant Sci; Comparison of ultrastructure, pollen tube growth pattern and starch content in developing and abortive ovaries during the progamic phase in hazel; JF Liu, HD Zhang, YQ Cheng, J Wang, YX Zhao, WT Geng; 5; 2014; 528; citation_id=CR3
• BMC Plant Biol; Identification of genes regulating ovary differentiation after pollination in hazel by comparative transcriptome analysis; YQ Cheng, YC Zhang, CM Liu, PF Ai, JF Liu; 18; 2018; 84; 10.1186/s12870-018-1296-3; citation_id=CR4
• Acta Horticulturae Sinica; Analysis of SSR-markers information and primer selection from transcriptome sequence of hybrid hazelnut Corylus heterophylla × C. avellana; YQ Cheng, LN Zhang, YB Zhao, JF Liu; 45; 2018; 139-148; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (5件)： 胚珠 ,  調節 ,  マイクロRNA ,  mRNA ,  同定