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J-GLOBAL ID：202102266147586905   整理番号：21A0161490

非モデル酵母Issatchenkia orientalis SD108のゲノムスケール代謝再構成と有機酸生産への応用【JST・京大機械翻訳】

Genome-scale metabolic reconstruction of the non-model yeast Issatchenkia orientalis SD108 and its application to organic acids production

著者 (11件)： Suthers Patrick F. (Department of Chemical Engineering, The Pennsylvania State University, University Park, PA, 16802, USA) ,  Dinh Hoang V. (Department of Chemical Engineering, The Pennsylvania State University, University Park, PA, 16802, USA) ,  Fatma Zia (Department of Chemical and Biomolecular Engineering, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, IL, USA) ,  Shen Yihui (Department of Chemistry, Princeton University, Princeton, NJ, USA) ,  Shen Yihui (Lewis-Sigler Institute for Integrative Genomics, Princeton University, Princeton, NJ, USA) ,  Chan Siu Hung Joshua (Department of Chemical Engineering, The Pennsylvania State University, University Park, PA, 16802, USA) ,  Rabinowitz Joshua D. (Department of Chemistry, Princeton University, Princeton, NJ, USA) ,  Rabinowitz Joshua D. (Lewis-Sigler Institute for Integrative Genomics, Princeton University, Princeton, NJ, USA) ,  Zhao Huimin (Department of Chemical and Biomolecular Engineering, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana, IL, USA) ,  Zhao Huimin (Carl R. Woese Institute for Genomic Biology, University of Illinois at Urbana-Champagne, Urbana, IL, USA) ,  Maranas Costas D. (Department of Chemical Engineering, The Pennsylvania State University, University Park, PA, 16802, USA)
資料名： Metabolic Engineering Communications  (Metabolic Engineering Communications)
巻： 11  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W2975A  ISSN： 2214-0301  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くのプラットフォーム化学物質は微生物による再生可能バイオマスから生産でき,有機酸は大きな画分を作る。しかし,得られた低pH成長条件への不耐性は,微生物による有機酸の工業生産に対する挑戦である。Issatchenkia orientalis SD108は,pH2.0の低い酸性条件に耐性があるため,工業生産のための有望な宿主である。この非モデル酵母の代謝能を系統的に評価する目的で,I.orientalis SD108の850遺伝子,1826の反応および1702の代謝産物に対するゲノム規模の代謝モデルを開発した。モデルの定量的予測を改善するために,生物特異的高分子組成とATP維持要求を実験的に決定し,実行した。Saccharomyces cerevisiaeの酵母8.3モデルと必須遺伝子およびフラックス結合解析を含むネットワークトポロジーを調べ,酵母8.3モデルと比較した。炭素基質利用を調べ,工業関連コハク酸に対する生物生産能力を調べ,OptKnockフレームワークを用いて,標的化学物質をバイオマス生産に結び付ける遺伝子ノックアウトを同定した。ゲノム規模の代謝モデルiIsor850は,過剰生産に対する遺伝的介入を知らせるデータ支援キュレーションモデルである。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 微生物 ,  炭素 ,  *有機酸 ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  基質 ,  *酵母 ,  代謝産物 ,  高分子 ,  生物生産 ,  *ゲノム ,  Saccharomyces cerevisiae ,  工業生産 ,  ハウスキーピング遺伝子
準シソーラス用語： バイオマス生産 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： ゲノムスケールモデル ,  非モデル酵母 ,  制約ベースモデリング ,  代謝工学

分類 (2件)： 代謝と栄養  (EG03054K) ,  微生物代謝産物の生産  (FK03020A)

タイトルに関連する用語 (8件)： モデル ,  酵母 ,  ゲノム ,  スケール ,  代謝 ,  再構成 ,  有機酸 ,  応用