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J-GLOBAL ID：202102270011009459   整理番号：21A1152104

オオムギにおけるソーマチン様蛋白質(TLP)遺伝子ファミリー:発芽中の全ゲノム探索と発現解析【JST・京大機械翻訳】

Thaumatin-Like Protein (TLP) Gene Family in Barley: Genome-Wide Exploration and Expression Analysis during Germination

著者 (4件)： Iqbal Irfan ,  Tripathi Rajiv Kumar ,  Wilkins Olivia ,  Singh Jaswinder
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 11  号： 9  ページ： 1080  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： タウマチン様蛋白質(TLP)は,植物防御,発生過程および種子発芽において重要な役割を果たすことが知られている。著者らは,イネ,Brachypodiumおよびモロコシゲノムからそれぞれオオムギおよび37,28および35TLP遺伝子の参照ゲノムから19のTLP遺伝子を同定した。比較系統解析はTLPファミリーを9群に分類した。多様なエキソン/イントロン構造を有する局在化遺伝子重複は,穀類におけるTLP遺伝子ファミリーの拡張に寄与した。オオムギTLPsの大部分は染色体5Hに局在していた。HvTLP遺伝子の時空間的発現パターンは,胚,発育中の粒,根およびシュート組織においてそれらの優勢な発現を示した。発芽の1696時間にわたる麦芽品種(Morex)におけるHvTLP14,HvTLP17およびHvTLP18の差次的発現は,麦芽におけるそれらの可能な役割を明らかにした。本研究は,オオムギにおけるTLP遺伝子ファミリーの記述と,種子発芽と麦芽加工における可能な関与を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  *オオムギ ,  麦芽 ,  *発芽 ,  *ゲノム ,  品種 ,  モロコシ ,  *ソーマチン ,  遺伝子重複 ,  イントロン
準シソーラス用語： *遺伝子発現プロファイリング ,  系統解析 ,  *遺伝子ファミリー ,  差次的遺伝子発現 ,  遺伝子発現パターン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： オオムギ ,  穀類 ,  ソーマチン様蛋白質 ,  系統発生学 ,  発現解析

分類 (4件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  進化論一般  (EC03010Q) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  菌類による植物病害  (FC04052Y)

引用文献 (44件)：

• Brandazza, A.; Angeli, S.; Tegoni, M.; Cambillau, C.; Pelosi, P. Plant stress proteins of the thaumatin-like family discovered in animals. FEBS Lett. 2004, 572, 3-7.
• Singh, S.; Tripathi, R.K.; Lemaux, P.G.; Buchanan, B.B.; Singh, J. Redox-dependent interaction between thaumatin-like protein and β-glucan influences malting quality of barley. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2017, 114, 7725-7730.
• Fils-Lycaon, B.R.; Wiersma, P.A.; Eastwell, K.C.; Sautiere, P. A cherry protein and its gene, abundantly expressed in ripening fruit, have been identified as thaumatin-like. Plant Physiol. 1996, 111, 269-273.
• van Loon, L.C.; Rep, M. Pieterse CM: Significance of inducible defense-related proteins in infected plants. Annu. Rev. Phytopathol. 2006, 44, 135-162.
• Velazhahan, R.; Datta, S.K.; Muthukrishnan, S. The PR-5 family: Thaumatin-like proteins. In Pathogenesis-Related Proteins in Plants; CRC Press: Boca Raton, FL, USA, 1999; pp. 107-129.

タイトルに関連する用語 (9件)： オオムギ ,  ソーマチン ,  蛋白質 ,  TLP ,  遺伝子ファミリー ,  発芽 ,  ゲノム ,  探索 ,  発現解析