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J-GLOBAL ID：202102272163870186   整理番号：21A2113858

トラン修飾ペプチド核酸によるSNP識別:病原菌における薬物耐性検出への応用【JST・京大機械翻訳】

SNP Discrimination by Tolane-Modified Peptide Nucleic Acids: Application for the Detection of Drug Resistance in Pathogens

著者 (10件)： Takagi Kenji (Department of Organic Fine Chemicals, The Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University, 8-1 Mihogaoka, Ibaraki, Osaka 567-0047, Japan) ,  Hayashi Tenko (Department of Organic Fine Chemicals, The Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University, 8-1 Mihogaoka, Ibaraki, Osaka 567-0047, Japan) ,  Sawada Shinjiro (Department of Organic Fine Chemicals, The Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University, 8-1 Mihogaoka, Ibaraki, Osaka 567-0047, Japan) ,  Okazaki Miku (Department of Organic Fine Chemicals, The Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University, 8-1 Mihogaoka, Ibaraki, Osaka 567-0047, Japan) ,  Hori Sakiko (Department of Organic Fine Chemicals, The Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University, 8-1 Mihogaoka, Ibaraki, Osaka 567-0047, Japan) ,  Ogata Katsuya (Department of Organic Fine Chemicals, The Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University, 8-1 Mihogaoka, Ibaraki, Osaka 567-0047, Japan) ,  Kato Nobuo (Department of Organic Fine Chemicals, The Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University, 8-1 Mihogaoka, Ibaraki, Osaka 567-0047, Japan) ,  Ebara Yasuhito (Graduate School of Human Development and Environment, Kobe University, 3-11 Tsurukabuto, Kobe, Hyogo 657-8501, Japan) ,  Kaihatsu Kunihiro (Department of Organic Fine Chemicals, The Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University, 8-1 Mihogaoka, Ibaraki, Osaka 567-0047, Japan) ,  Kaihatsu Kunihiro (Graduate School of Human Development and Environment, Kobe University, 3-11 Tsurukabuto, Kobe, Hyogo 657-8501, Japan)
資料名： Molecules (Web)  (Molecules (Web))
巻： 25  号： 4  ページ： 769  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7014A  ISSN： 1420-3049  CODEN： MOLEFW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ウイルスまたは細菌感染の治療の間,使用される治療剤に対する耐性を評価することが重要である。特定の遺伝子における単一塩基変異から生じるアミノ酸置換はしばしば病原体の薬剤耐性を引き起こす。したがって,標的配列における単一塩基ミスマッチを識別する分子ツールは治療成功を達成するために必要である。ここでは,N末端でのアミド結合を介してトランで誘導体化したペプチド核酸(PNA)を合成し,二本鎖の末端領域近くに位置するミスマッチ塩基対でも配列特異性の改善に成功した。UV-融解温度分析,熱力学分析,in silico立体配座探索,およびゲル移動度シフトアッセイによって,一本鎖DNAおよびRNAに対するトラン-PNAの配列特異性を評価した。結果として,PNA-tolan誘導体の全てはミスマッチ標的結合を誘導することなく,マッチした標的配列に二本鎖形成を安定化した。異なるPNA-トラン誘導体の中で,ナフチル型トランで修飾されたPNAは,ミスマッチ塩基対を効率的に識別でき,インフルエンザA/H1N1ウイルスのノイラミニダーゼ阻害剤に対する耐性の検出に利用できる。したがって,著者らの分子ツールは,病原体における薬剤耐性に関連する単一ヌクレオチド多型を識別するのに用いることができる。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 移動度 ,  ゲル ,  融点 ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *薬物耐性 ,  インフルエンザ ,  細菌感染 ,  病原体 ,  不適正塩基対 ,  一塩基多型
準シソーラス用語： *ペプチド核酸 ,  アミノ酸置換 ,  アミド結合 ,  立体配座解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ペプチド核酸 ,  トランレーン ,  単一ヌクレオチド多型 ,  インフルエンザウイルス ,  薬剤耐性

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

引用文献 (26件)：

• Scitable. Definition, SNP. Available online: https://www.nature.com/scitable/definition/snp-295/ (accessed on 10 February 2020).
• Li, J.Z.; Paredes, R.; Ribaudo, H.J.; Svarovskaia, E.S.; Metzner, K.J.; Kozal, M.J.; Hullsiek, K.H.; Balduin, M.; Jakobsen, M.R.; Geretti, A.M.; et al. Low-frequency HIV-1 drug resistance mutations and risk of NNRTI-based antiretroviral treatment failure: A systematic review and pooled analysis. JAMA 2011, 305, 1327-1335.
• Suzuki, Y.; Saito, R.; Sato, I.; Zaraket, H.; Nishikawa, M.; Tamura, T.; Dapat, C.; Caperig-Dapat, I.; Baranovich, T.; Suzuki, T.; et al. Identification of Oseltamivir Resistance among Pandemic and Seasonal Influenza A (H1N1) Viruses by an His275Tyr Genotyping Assay Using the Cycling Probe Method. J. Clin. Microbiol. 2011, 49, 125-130.
• Nielsen, P.; Egholm, M.; Berg, R.; Buchardt, O. Sequence-selective recognition of DNA by strand displacement with a thymine-substituted polyamide. Science 1991, 254, 1497-1500.
• Hanvey, J.; Peffer, N.; Bisi, J.; Thomson, S.; Cadilla, R.; Josey, J.; Ricca, D.; Hassman, C.; Bonham, M.; Au, K.; et al. Antisense and antigene properties of peptide nucleic acids. Science 1992, 258, 1481-1485.

タイトルに関連する用語 (8件)： トラン ,  修飾 ,  ペプチド核酸 ,  SNP ,  識別 ,  病原菌 ,  薬物耐性 ,  応用