ザンジバルの尿サンプルにおける異なる強度のSchistosomaヘマトビウム感染を診断するためのリアルタイムPCR法の性能【JST・京大機械翻訳】

Keller Dominique; Rothen Julian; Rothen Julian; Dangy Jean-Pierre; Dangy Jean-Pierre; Saner Corina; Daubenberger Claudia; Daubenberger Claudia; Allan Fiona; Ame Shaali M.; Ali Said M.; Kabole Fatma; Hattendorf Jan; Hattendorf Jan; Rollinson David; Seyfarth Ralf; Knopp Stefanie; Knopp Stefanie

文献

J-GLOBAL ID：202102282944316769 整理番号：21A0290641

ザンジバルの尿サンプルにおける異なる強度のSchistosomaヘマトビウム感染を診断するためのリアルタイムPCR法の性能【JST・京大機械翻訳】

Performance of a real-time PCR approach for diagnosing Schistosoma haematobium infections of different intensity in urine samples from Zanzibar

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資料名：
巻： 9 号： 1 ページ： 1-13 発行年： 2020年
JST資料番号： U7496A ISSN： 2049-9957 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

住血吸虫症を制御し,除去する努力は過去10年間にわたって加速した。寄生虫負荷として,関連する罹患率と卵排泄が減少するため,標準的な寄生虫学的方法による診断はより硬くなる。尿濾過顕微鏡と試薬ストリップ試験との比較において,異なる強度のSchistosoma血液菌感染症の診断のためのリアルタイムPCR(qPCR)アプローチのロバスト性と性能を評価した。DNA単離とqPCRのロバスト性をヨーロッパとアフリカの8つの研究室で検証した。続いて,2012~2017年のSchistosomia感染(ZEST)プロジェクトのZanzibar Eliminationの横断的調査中に採取した792の尿試料を,2018年にqPCRで調べた。参照試験として尿濾過顕微鏡を用いて,異なる感染強度カテゴリーでqPCRの診断感度を計算した。Ct値とS.haematobium卵数の間のSpearmanの順位相関を評価し,感染強度カテゴリーのCt値パーセンタイルを測定した。S.haematobium Dra1DNA陽性試料は,8つの研究室すべてで正しく同定された。Zanzibarからの尿試料の検査は,qPCRによる26.8%(212/792)のDra1DNA,尿濾過による13.3%(105/792)のS.haematobium卵,および試薬ストリップによる13.8%(109/792)の微小血尿を明らかにした。qPCRの感受性は,卵数の増加とともに増加し,1と4卵の間の計数で80.6%(29/36),83.3%(15/18)で,5と9卵の間の計数で83.3%(15/18),10と49の卵の間で100%(23/23),および50+卵の数で96.4%(27/28)であった。Ct値と卵数の間には有意な負の相関があった(Spearman rho=-0.49,P<0.001)。Ct値の75%は,卵陰性カテゴリーで≧33,光度カテゴリーで<31,重強度カテゴリーで<24であった。qPCRの感度は,非常に軽い強度感染(卵数<10)に対して>80%であったが,一般に,Dra1に基づくqPCR分析は,古典的寄生虫試験と比較して,多くのS.haematobium感染の2倍を検出した。したがって,qPCRは,住血吸虫除去プログラム,個々の診断,および除去の証明と認証のための改良フォーマットの衝撃評価に使用できるS.haematobium診断のための高感度,尿ベースのアプローチである。ISRCTN,ISRCTN48837681。2012年9月~2012年9月に登録されている。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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感染症・寄生虫症の診断 , 感染症・寄生虫症一般

引用文献 (39件)：

Schistosomiasis: progress report 2001-2011 and strategic plan 2012-2020; 2013; CR1; citation_publisher=World Health Organization
Lancet; Global, regional, and national disability-adjusted life-years (DALYs) for 359 diseases and injuries and healthy life expectancy (HALE) for 195 countries and territories, 1990-2017: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2017; ; 392; 10159; 2018; 1859-1922; 10.1016/S0140-6736(18)32335-3; citation_id=CR2
Accelerating work to overcome the global impact of neglected tropical diseases - a roadmap for implementation; 2012; CR3; citation_publisher=World Health Organization
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Week Epid Rec; Schistosomiasis and soil-transmitted helminthiases: number of people treated in 2017; ; 50; 93; 2018; 681-692; citation_id=CR5

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