ゲノム集団分析により明らかにしたオランダ,アムステルダムにおける2014~2009間のセファロスポリン還元感受性Neisseria gonorrhoeaeクローンの出現【JST・京大機械翻訳】

de Korne-Elenbaas, J.; Bruisten, S. M.; de Vries, H. J. C.; van Dam, A. P.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202200077500433 整理番号：22P0252099

ゲノム集団分析により明らかにしたオランダ,アムステルダムにおける2014~2009間のセファロスポリン還元感受性Neisseria gonorrhoeaeクローンの出現【JST・京大機械翻訳】

Emergence of a cephalosporin reduced susceptible Neisseria gonorrhoeae clone between 2014-2019 in Amsterdam, the Netherlands, revealed by a genomic population analysis

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発行年： 2020年11月03日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年11月03日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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【背景】Neisseria gonorrhoeae(Ng)におけるセファロスポリンへの耐性は,これらが最後のリゾートの抗生物質と考えられているので,主要な公衆衛生脅威である。連続監視は,感受性および耐性株の循環をモニターするのに必要である。【目的】疫学的サーベイランスの目的で,セフトリアキソン還元感受性分離株に焦点を当てて,AmsterdamからのNg分離株についてゲノム集団分析を実施した。【方法】オランダ,Amsterdamから2014~2019年に318の分離株から全ゲノム配列を得た。分離株をマルチローカ配列Typing(MLST)スキームに従ってタイプ分けし,抵抗マーカーを同定した。系統樹を作成し,遺伝的クラスターを同定し,オランダおよびグローバルMLST7827分離株を比較した。【結果】セフトリアキソンの大多数は,MLST7363,MLST1901およびMLST7827に属した。MLST7363とMLST1901は,2014~2016年の感受性系統が優勢であったが,MLST7827は2017~2019年の間に優勢になった。MLST7827は感受性分離株がA501V変異とporB G121K/A121D変異を有する非モザイク性ペンA遺伝子を保有し,感受性MLST7827分離株に欠けていた。すべての公的に利用可能なMLST7827分離株の系統発生分析は,オランダおよび他のヨーロッパMLST7827分離株の強い遺伝的クラスタ化を示した。結論:セフトリアキソンは感受性MLST7827分離株をアムステルダムで近年出現した。ペンA A501VとporB G121K/A121D変異の共起は,セフトリアキソン低下感受性と強く関連していた。オランダおよび他のヨーロッパMLST7827分離株の遺伝的クラスタ化は,ヨーロッパにおけるこの菌株の広範な循環を示している。したがって,警報感受率プロファイルによるこの歪の広がりの密接なモニタリングが必要である。【JST・京大機械翻訳】

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