piRNA様低分子RNAはクレードIV寄生線虫における転移要素を標的とする【JST・京大機械翻訳】

Suleiman, M.; Kohnosu, A.; Murcott, B.; Dayi, M.; Pawluk, R.; Yoshida, A.; Viney, M.; Kikuchi, T.; Hunt, V. L.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202200085299305 整理番号：22P0315981

piRNA様低分子RNAはクレードIV寄生線虫における転移要素を標的とする【JST・京大機械翻訳】

piRNA-like small RNAs target transposable elements in a Clade IV parasitic nematode

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発行年： 2022年02月22日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月22日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

モデル生物Caenorhabditis elegansにおいて同定された小RNA(sRNA)経路は線虫を通して広く保存されていない。例えば,PIWI経路とPIWI相互作用RNA(piRNAs)は,ほとんどの動物で転移可能な要素(TE)の調節とサイレンシングに関与するが,Caenorhabditis elegans群(Clade V)の外で線虫で失われ,PIWI経路がない場合,線虫がTEsをどのように調節するかについてはほとんど知られていない。ここでは,2つの遺伝的に同一の成体段階(寄生雌と自由生活雌)を比較することにより,Clade IV寄生線虫Strongyloides rattiにおけるsRNAの役割を調べた。推定上の小干渉RNA,マイクロRNAおよびtRNA由来sRNAフラグメントを同定し,2つの成体段階間で差次的に発現した。sRNAの2つのクラスは,(i)5ウラシル(21-22Us)とモノリン酸修飾を有する21-22nt長sRNAの寄生虫関連クラス,および(ii)5グアニン/アデニン(27GAs)とポリリン酸塩修飾を有する27nt長sRNAを含むTE活性を調節すると予測された。21-22Usは,ゲノムにおけるATリッチ上流配列,重複遺伝子座および物理的クラスタ化を含むC.elegansにおいて見出された21U PIWI相互作用RNAと顕著な類似性を示した。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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