単一細胞におけるmRNAと蛋白質の同時定量は遺伝的変異の転写後効果を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Brion, C.; Lutz, S.; Albert, F. W.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202200136310872 整理番号：22P0240721

単一細胞におけるmRNAと蛋白質の同時定量は遺伝的変異の転写後効果を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Simultaneous quantification of mRNA and protein in single cells reveals post-transcriptional effects of genetic variation

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発行年： 2020年07月03日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年07月03日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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トランス作用DNA変異体はゲノム全体に位置する遺伝子のmRNAまたは蛋白質レベルに特異的に影響する可能性がある。しかし,以前の研究は,別々に,または,限られた統計的パワーで実行された研究でマッピングされたトランス作用遺伝子座を比較した。ここでは,酵母Saccharomyces cerevisiaeの単一生細胞における二重蛍光レポーターを介して,与えられた遺伝子のmRNAと蛋白質の同時定量のためのCRISPRに基づくシステムを開発した。2つの遺伝的に分岐した菌株間の交雑からの組換え細胞の大集団において,10遺伝子の発現に影響を及ぼす86のトランス作用遺伝子座をマッピングした。これらの遺伝子座の20%未満は,同じ遺伝子のmRNAと蛋白質に一致効果を持っていた。大部分の遺伝子座は,与えられた遺伝子のmRNAではなく蛋白質に影響した。そのような遺伝子座の1つはYAK1キナーゼ遺伝子に未熟な停止変異体を持ち,それは遺伝子の数十の蛋白質またはmRNAに特異的影響を及ぼした。これらの結果は,遺伝子発現に対する複雑な転写後遺伝的影響を示す。1つの文章要約A CRISPRに基づく二重レポーターアッセイは,トランスのmRNAまたは蛋白質レベルに特異的に影響するDNA変異体の遺伝的マッピングを可能にする。関心の競争を競争することは,競合する興味を宣言していない。View Full Text【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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