E.coliの転写因子ネットワークはRNAP濃度におけるシフトに対する全体的応答を示す【JST・京大機械翻訳】

Lima de Brito Almeida, B.; Bahrudeen, M. N. M.; Chauhan, V.; Dash, S.; Kandavalli, V.; Hakkinen, A.; Lloyd-Price, J.; Palma, C. S. D.; Baptista, I. S. C.; Gupta, A.; Kesseli, J.; Dufour, E.; Smolander, O.-P.; Nykter, M.; Auvinen, P.; Jacobs, H. T.; Oliveira, S. M. D.; Ribeiro, A. S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202200207629859 整理番号：22P0317357

E.coliの転写因子ネットワークはRNAP濃度におけるシフトに対する全体的応答を示す【JST・京大機械翻訳】

The transcription factor network of E. coli steers global responses to shifts in RNAP concentration

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資料名：
発行年： 2022年03月08日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月08日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

環境変化に対する遺伝子ネットワークのロバスト性と感度は,細胞生存に重要である。遺伝子ネットワークがゲノムワイド摂動に対して特異的,年代的に秩序化した応答を生成するが,ホメオスタシスをロバストに維持することは未解決の疑問のままである。RNAポリメラーゼ(RNAP)濃度のシフトに対する短期及び中期ゲノムワイド応答が大腸菌の転写因子ネットワーク(TFN)の既知トポロジー及び論理により影響されるかどうかを解析した。遺伝子コホートレベルでは,単一遺伝子の大きさ,RNAP濃度の変化に対する中期転写応答が,活性化と再抑制入力転写因子(TF)の遺伝子数の間の絶対差により説明できることを見出した。興味深いことに,この違いは遺伝子の入力TFの数と強く正相関した。一方,短期応答はTFNから弱い影響を示した。これらの結果は,遺伝子コホートがゲノムワイドストレスに応答する大腸菌形状のTFNの全体的なトポロジー形質を示唆する。【JST・京大機械翻訳】

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, 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現

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