全ゲノムマイクロアレイ分析からのBifidobacterium adolescentis DSMZ20083におけるβ-マンノオリゴ糖取込と代謝への洞察【JST・京大機械翻訳】

Mary, P. R.; P, M.; Kapoor, M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202200460251676 整理番号：22P0317574

全ゲノムマイクロアレイ分析からのBifidobacterium adolescentis DSMZ20083におけるβ-マンノオリゴ糖取込と代謝への洞察【JST・京大機械翻訳】

Insights into β-manno-oligosaccharide uptake and metabolism in Bifidobacterium adolescentis DSMZ 20083 from whole-genome microarray analysis

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発行年： 2022年03月09日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月09日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

【目的】食事{β}-マンノオリゴ糖を利用し,根底にある分子機構を理解するために,成人関連B.adolescentis DSMZ20083の能力を測定する。方法および結果:in vitro発酵とTLCを用いて,グアルゴム,ローカストビーンガム,コンニャクおよびコプラミールから{β}-マンノオリゴ糖を利用するB.adolescentis DSMZ20083の能力を測定した。さらに,全ゲノムトランスクリプトーム解析,q-RT-PCRおよび分子ドッキングを用いて,B.adolescentis DSMZ20083におけるコプラミール{β}-manno-oligosaccharides(CM-{β}-MOS)利用経路を再構成した。B.adolescentis DSMZ20083は,試験した全ての{β}-マンノ-オリゴ糖上で,かなり(A600nmまで),しかしCM-{β}-MOS上で最大に成長した。トランスクリプトーム分析は,ABC輸送体カセット(ESBPsおよびパーミアーゼ),MFS輸送体,GH1{β}-グルコシダーゼおよびGH32{β}-フルクトフラノシダーゼをコードする3つの異なる遺伝子クラスターの差次的アップレギュレーションを明らかにした。ABCおよびMFSは,それぞれ,主にDP[≧]2およびDP[≧]3CM-{β}-MOSを輸送した。糖吸収と利用経路;ABC輸送系,ピルビン酸代謝,解糖/グルコネオゲネシス,ペントースおよびグルコロン酸相互変換もアップレギュレートされた。【結語】B.adolescentis DSMZ20083は,おそらくABC&MFSトランスポーターを内部化およびGH1{β}-グルコシダーゼ,およびGH32{β}-フルクトフラノシダーゼを用いて,CM-{β}-MOSを解体する。B.adolescentis DSMZ 20083により使用される可能な分子決定因子を,{β}-マンノオリゴ糖を利用して,このようにして,正確なミクロビオーム調節で資源を証明できる,研究の意義と影響を研究した。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現 , 微生物の生化学 , 遺伝子操作

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