抗CRISPRファミリーAcrIF7の分布と分子進化【JST・京大機械翻訳】

Figueroa, W.; Cazares, A.; Cazares, D.; Wu, Y.; De la Cruz, A.; Welch, M.; Kameyama, L.; Nobrega, F.; Guarneros, G.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202200534629072 整理番号：21P0259039

抗CRISPRファミリーAcrIF7の分布と分子進化【JST・京大機械翻訳】

Distribution and molecular evolution of the anti-CRISPR family AcrIF7

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発行年： 2022年03月23日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月23日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

抗CRISPRはCRISPR-Cas系を遮断し,典型的には移動性遺伝要素にコードされる蛋白質である。それらの発見以来,多数の抗CRISPRファミリーが同定された。しかし,家族内のメンバーの分布および配列多様性,およびこれらの形質が抗CRISPRs機能および進化にどのように影響するかについてはほとんど知られていない。ここでは,AcrIF7を用いて抗CRISPRファミリーの播種と分子進化を調べた。グループ内の5つのサブクラスタと一般的な抗CRISPR変異体を明らかにした。注目すべきことに,AcrIF7相同体は,それらの広い地理的,生態学的および時間的分布にもかかわらず,高い類似性を示す。主にPseudomonas aeruginosaと関連するが,AcrIF7は,主にファージによる水平伝播を示す異なる遺伝的背景で同定された。変異誘発を用いて,データベースで観察された変異を再構築したが,群の配列多様性を拡大した。変異体の特性化は抗CRISPR機能に対する残基鍵を同定し,その変異耐性に寄与する。さらに,分子ドッキングは,影響を受けた機能を有する変異体がそのCRISPR-Cas標的との鍵となる相互作用を失うことを明らかにした。公的に利用可能なデータと生成された変異体の解析は,優性AcrIF7変異体が家族で選択された最小および最適抗CRISPRに対応することを示唆する。本研究は,抗CRISPRファミリーの分子進化を研究するための青写真を提供する。【JST・京大機械翻訳】

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微生物の生化学

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