マダガスカルからの野生捕獲ハウスマウスハツカネズミの全ゲノム配列解析【JST・京大機械翻訳】

Fujiwara, K.; Ranorosoa, M. C.; Ohdachi, S. D.; Arai, S.; Sakuma, Y.; Suzuki, H.; Osada, N.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202200578783826 整理番号：21P0266199

マダガスカルからの野生捕獲ハウスマウスハツカネズミの全ゲノム配列解析【JST・京大機械翻訳】

Whole-genome sequencing analysis of wild-caught house mice Mus musculus from Madagascar

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発行年： 2022年03月23日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月23日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

マダガスカルでは,ハウスマウス(ハツカネズミ)は,ヒト活動でコロニー化され,現在,島で最も豊富な齧歯類の1つであると考えられている。本研究では,野生から捕獲された5つのマダガスカルハウスマウスの全ゲノム配列を決定した。ミトコンドリアと常染色体ゲノムを解析することにより,個体群の進化史を調べた。著者らは,マダガスカルハウスマウスのミトコンドリアゲノム系統が,種における最も基本的な位置の1つに位置する単系統群を形成することを確認した。常染色体ゲノム配列の解析は,マダガスカルハウスマウスがM.m.castaneus(CAS)の遺伝子メンバーであるが,亜種間の交雑から生じるM.m.domestica(DOM)の遺伝的要素を含むことを示す。ミトコンドリアおよび常染色体ゲノムデータの両者において,強い集団ボトルネックの1000-3000年前のシグネチャが観察された。すべてのサンプルは,約4000年前に推定した発散時間によって,広範囲のインド洋沿岸と島地域にわたって多くのCASサンプルに強い遺伝的親和性を示した。これらの知見から,マダガスカルハウスマウスは,ヒト農業活動で島を定着し始め,設立のための複雑な歴史を経験した。【JST・京大機械翻訳】

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進化論一般 , 遺伝子の構造と化学

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