mRNA存在量における表現型情報の定量化【JST・京大機械翻訳】

Maltz, E. W.; Wollman, R.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202200774845180 整理番号：22P0316232

mRNA存在量における表現型情報の定量化【JST・京大機械翻訳】

Quantifying the phenotypic information in mRNA abundance

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発行年： 2022年02月24日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月24日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

mRNA存在量と下流細胞表現型間の依存性の定量化は生物学における基本的未解決問題である。マルチモーダル単一細胞測定技術の進歩は,与えられた表現型に対する個々の遺伝子および遺伝子の組み合わせの寄与を分析する新しい計算フレームワークを適用する機会を提供する。情報理論アプローチを用いて,Ca ̄2+シグナル伝達ネットワークにおける83遺伝子の発現および同じ細胞における動的Ca ̄2+応答のマルチモーダルデータを解析した。これらの83遺伝子の全体的な発現レベルがCa ̄2+シグナルエントロピーの約60%を説明することを見出した。各単一遺伝子の平均寄与は16%であり,遺伝子間の大きな冗長性を明らかにした。異なる発見的方法を用い,遺伝子集合のサイズとその情報量の間の依存性を推定し,平均で53遺伝子セットが細胞転写状態内のCa ̄2+シグナリングに関する情報の90%を含むことを明らかにした。本結果は,mRNA存在量測定に存在する複雑な細胞表現型に関する情報量の最初の直接定量を提供する。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現 , 分子・遺伝情報処理

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