OTTERS:強力なTWASフレームワークは要約レベル参照データを集中する【JST・京大機械翻訳】

Dai, Q.; Zhou, G.; Zhao, H.; Vosa, U.; Franke, L.; Battle, A.; Teumer, A.; Lehtimaki, T.; Raitakari, O.; Esko, T.; eQTLGen Consortium,; Epstein, M. P.; Yang, J.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202200850721746 整理番号：22P0326075

OTTERS:強力なTWASフレームワークは要約レベル参照データを集中する【JST・京大機械翻訳】

OTTERS: A powerful TWAS framework leveraging summary-level reference data

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発行年： 2022年12月10日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年12月10日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ほとんどの既存のTWASツールは,個人レベルのeQTL参照データを必要とし,従って,要約レベルの参照eQTLデータセットには適用できない。要約レベル基準データを利用することができるTWAS法の開発は,より広い設定でTWASを可能にし,参照サンプルサイズの増大により電力を高めるのに有用である。したがって,要約レベルeQTL参照データからeQTL重みを推定し,全バスTWASを実施するために,複数の多遺伝子リスクスコア(PRS)法を適応させる,OTTERS(Omnibusトランスクリプトーム試験)と呼ばれるTWASフレームワークを開発した。OTTERSはシミュレーションと応用研究の両方による実用的で強力なTWASツールであることを示した。【JST・京大機械翻訳】

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, , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現

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