HIV系統学はパキスタンの都市と主要集団間の重複伝染ネットワークを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

de Bernardi Schneider, A.; Cholette, F.; Pelcat, Y.; Lim, A. G.; Vickerman, P. T.; Hassan, A.; Thompson, L. H.; Blanchard, J. F.; Emmanuel, F.; Reza, T.; Dar, N.; Ikram, N.; Pilon, R.; Archibald, C.; Joy, J. B.; Sandstrom, P.; Wertheim, J. O.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202200982213375 整理番号：22P0033458

HIV系統学はパキスタンの都市と主要集団間の重複伝染ネットワークを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

HIV Phylogenetics Reveals Overlapping Transmission Networks among Cities and Key Populations in Pakistan

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資料名：
発行年： 2022年01月17日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月17日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

パキスタンにおけるHIVの最初の症例は1987年に記録され,複数のサブタイプと循環組換え型が導入され,現在国において循環している。それ以来,低罹患率/高リスクから高リスク集中流行への国のシフトがあった。パキスタンの流行は,薬剤(PWID),Hijra性労働者(HSW),女性性労働者(FSW),男性性労働者(MSW),および男性(MSM)の性別を有する男性を含む人々を含むHIV感染のより大きなリスクで,重要な集団の間で集中している。本研究は,HIVを契約するリスクの高い重要な集団間の相互作用と同様に,地理的側面に焦点を当てた。著者らは,パキスタンにおける複数のHIV-1導入の可能性を調べるとともに,高い粒度を有する分子レベルでのこれらの重要な集団の挙動を理解することを目的とした。この横断的生物学的および行動的調査において,著者らは,パキスタンの17の都市における個人からの血清有病率推定および分子疫学の目的で,PWID,HSW,MSWおよびFSWの4つの重要な集団を代表する,乾燥血液スポット(DBS)を収集した。HIVの全部で1153のエンベロープ配列(HXB2:7860~8274)をサンガーベースの配列決定法を用いて配列決定した。外国諸国からのパキスタンにおけるウイルスの導入に基づくクラスタを同定するために,3623の公的に利用可能なHIVエンベロープ配列を著者らのデータセットに加えた。地理的推論は,パキスタンへのウイルスの少なくとも15の独立した導入と,パキスタンと近隣の国からの配列を含むサイズにおける3から675の配列にわたる合計12のクラスタを有する。著者らの系統発生解析は,パキスタンの都市と重要な個体群間のHIV-1伝染の幅広い重複ネットワークを示唆する,有意な連結性と方向性を示した。【JST・京大機械翻訳】

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感染症・寄生虫症一般

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