比較メタプロテオミクスは複雑な粒状スラッジマイクロバイオームに関する異なる見解を示す【JST・京大機械翻訳】

Kleikamp, H. B. C.; Grouzdev, D.; Schaasberg, P.; van Valderen, R.; van der Zwaan, R.; van de Wijgaart, R.; Lin, Y.; Abbas, B.; Pronk, M.; van Loosdrecht, M. C. M.; Pabst, M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202201086662132 整理番号：22P0317412

比較メタプロテオミクスは複雑な粒状スラッジマイクロバイオームに関する異なる見解を示す【JST・京大機械翻訳】

Comparative metaproteomics demonstrates different views on the complex granular sludge microbiome

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著者 (11件)： , , , , , , , , , ,
資料名：
発行年： 2022年03月08日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月08日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

配列決定技術における大きな進歩は,16Sのアンプリコンとミクロビオーム研究における全メタゲノム配列決定ルーチンを作った。さらに,質量分析技術の進歩は,従来のプロテオミクスを微生物生態学の分野に拡大した。メタプロテオミクスと共通して,この手法は遺伝子産物(すなわち,蛋白質)を測定し,その後,完全微生物群集の活発に発現された代謝経路と蛋白質-バイオマス組成を同定する。しかし,これらのアプローチの直交特性を決定するために,メタプロテオミクスおよびゲノムアプローチに関するより体系的な研究が必要である。ここでは,異なる廃水処理プラントから得られた複雑な好気性粒状スラッジミクロビオームに関する深い比較メタプロテオーム研究について述べた。従って,著者らは,オミックアプローチおよび参照配列データベースに依存して,中央栄養除去生物上で得られる異なる見解を示した。さらに,異なるオミクスアプローチからのデータのより正確な解釈を可能にする均質化ゲノムTaxonomyデータベース(GTDB)を示した。最後に,著者らの系統的研究は,複雑なミクロビオームの特性化におけるメタプロテオミクスの重要性を強調する。科学的報告におけるアプローチと精度の比較を改善するために,正確な参照配列データベースの必要性。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

微生物の生態 , 微生物の生化学 , 生物科学研究法一般

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