Streptomyces venezuelaeにおけるLexA仲介DNA損傷応答のゲノムワイド同定【JST・京大機械翻訳】

Stratton, K. J.; Bush, M. J.; Chandra, G.; Stevenson, C. E. M.; Findlay, K.; Schlimpert, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202201101617319 整理番号：22P0319430

Streptomyces venezuelaeにおけるLexA仲介DNA損傷応答のゲノムワイド同定【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide identification of the LexA-mediated DNA damage response in Streptomyces venezuelae

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発行年： 2022年06月18日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年06月18日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

DNA損傷は,2つの重要な調節因子,活性化因子RecAおよび転写レプレッサーLexAを含むSOS応答と呼ばれる細菌における広く保存されたストレス応答を誘発する。SOS応答の広い保存にもかかわらず,LexAによって制御された遺伝子の数は,異なる生物間でかなり異なる。Streptomyces属の糸状土壌-住居細菌はLexAとRecA相同体を含むが,Streptomycesにおけるこれらの役割は系統的に研究されていない。ここでは,RecAとLexAが,DNA損傷条件中のStreptomyces venezuelaeの生存と,非摂動増殖中の正常発生に必要であることを示す。蛍光recAプロモーター融合とLexA蛋白質レベルの活性をモニタリングすると,SOS応答の活性化はS.venzuelaeで遅延した。全体的転写プロファイリングとChIP-seq分析を結合することにより,著者らは,LexAレギュロンを決定し,DNAアルキル化剤マイトマイシンCによる治療に応答して発現するDNA損傷修復遺伝子のコアセットを定義した。結果は,LexAのDNA損傷が誘導する分解が,LexA標的遺伝子の異なる調節を生じることを示す。表面プラズモン共鳴を用いて,著者らはさらにLexA DNA結合モチーフ(SOSボックス)を確認し,LexAが標的プロモーターに対して堅固だが異なる結合親和性を示すことを示し,DNA損傷に対する段階的応答を示す。IMPORTANCEは,DNA損傷条件下で誘導される細菌SOS応答のレプレッサーとして機能する。これは生存と適応に重要な遺伝子の発現をもたらす。ここでは,Streptomyces細菌を生産する糸状抗生物質におけるLexAにより制御された調節ネットワークを報告し,StreptomycesにおけるSOS応答の存在を確立した。まとめると,著者らの研究は,これらの重要な細菌が環境に適応する方法を理解するために,さらなる研究を促進するStreptomycesにおけるDNA損傷応答への重要な洞察を明らかにした。【JST・京大機械翻訳】

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微生物の生化学 , 分子遺伝学一般 , 生物学的機能

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