適応免疫受容体レパートリーの参照ベース比較【JST・京大機械翻訳】

Weber, C. R.; Rubio, T.; Wang, L.; Zhang, W.; Robert, P. A.; Akbar, R.; Snapkov, I.; Wu, J.; Kuijjer, M. L.; Campos, S. T.; Conesa, A.; Sandve, G. K.; Liu, X.; Reddy, S. T.; Greiff, V.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202201138853020 整理番号：22P0313117

適応免疫受容体レパートリーの参照ベース比較【JST・京大機械翻訳】

Reference-based comparison of adaptive immune receptor repertoires

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資料名：
発行年： 2022年01月23日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月23日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

B-およびT-細胞受容体(免疫)レパートリーは,個人の免疫履歴を表すことができる。現在のレパートリー解析法は健康と疾患状態を識別することを目的とするが,典型的には限られた数のパラメータ(例えばクローン多様性,生殖系列使用)のみに基づいている。ここでは,免疫REF:適応免疫レパートリー(およびトランスクリプトーム)類似性の定量的多次元尺度を,レパートリー特徴およびシミュレーションおよび実験データセットの交差参照の両方に依存して,免疫レパートリー変化の解釈を可能にする,Rパッケージに実装し,既知類似性および異種性を有する免疫レパートリーの検出感受性に基づいて検証した。健康と疾患にわたる免疫レパートリー類似性景観を定量化するために,免疫状態(健康,[自己免疫]疾患と感染[Covid-19],免疫細胞集団)の個人から,免疫REFを>2400データセットに適用した。重要なことは,現在のパラダイムとは対照的に,健康と病気の個人の血液由来免疫レパートリーが特定の免疫状態に対して高度に類似していることを発見し,免疫摂動へのレパートリー変化が以前に考えられていたよりも顕著ではないことを示唆する。結論として,免疫REFは,免疫レパートリー類似性の集団全体の分析を実行し,従って,健康および疾患状態にわたる適応免疫反応の研究を可能にする。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

免疫反応一般 , 生体防御と免疫系研究法 , 細胞膜の受容体

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