ドナー全血DNAメチル化は非血縁ドナー同種造血細胞移植における急性移植片対宿主疾患の強力な予測因子ではない【JST・京大機械翻訳】

Webster, A. P.; Ecker, S.; Moghul, I.; Dhami, P.; Marzi, S.; Paul, D. S.; Kuxhausen, M.; Lee, S. J.; Spellman, S. R.; Wang, T.; Feber, A.; Rakyan, V.; Peggs, K. S.; Beck, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202201186883098 整理番号：22P0321349

ドナー全血DNAメチル化は非血縁ドナー同種造血細胞移植における急性移植片対宿主疾患の強力な予測因子ではない【JST・京大機械翻訳】

Donor whole blood DNA methylation is not a strong predictor of acute graft versus host disease in unrelated donor allogeneic haematopoietic cell transplantation

出版者サイト {{ this.onShowPLink() }} 複写サービスで全文入手
高度な検索・分析はJDreamⅢで

この文献はプレプリントです。プレプリントについてはこちらをご確認ください。

著者 (14件)： , , , , , , , , , , , , ,
資料名：
発行年： 2022年03月10日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月10日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

同種造血細胞移植(HCT)は,多くの血液ベースの疾患および悪性腫瘍を治療するために使用される。これは効果的な治療であるが,急性移植片対宿主病(aGVHD)の発症のような重大な有害事象を生じる。本研究は,aGVHDの発生率を減らすためにHCTにおけるドナー選択に使用できるドナー特異的エピジェネティック分類器を開発することを目的とした。本研究の発見コホートは,HLA-A,-B,-C,および-DRB1を受けた母集団からの288人のドナーからなり,骨髄破壊調整後の急性白血病または骨髄異形成症候群の治療のために,T細胞修復末梢血幹細胞移植片と無関係なドナーHCTをマッチさせた。ドナーは,レシピエントaGVHD転帰に基づいて選択した;このコホートは,aGVHDグレードIII~IVの144症例と,性別,年齢,疾患およびGVHD予防にマッチしたHCTの少なくとも100日後に生存したaGVHDのない144の対照から成った。ゲノムワイドDNAメチル化をInfiniumメチル化EPIC BeadChip(Illumina)を用いて評価し,ゲノム全体で>850,000部位でCpGメチル化を測定した。品質管理,前処理および探索分析に続いて,著者らは,aGVHDのCpG部位予測を同定するために,機械学習アルゴリズム(Random森林)を適用した。これらの部位の受信者動作特性(ROC)曲線分析は,0.91のROC曲線(AUC)下で有望な領域を有する分類器をもたらした。この分類器を試験するために,発見コホートと同じ基準を用いて選択した独立検証コホート(n=288)を使用した。独立した検証コホートを用いた分類器の検証に対する異なる試みは,AUCが0.51まで低下するのに失敗した。これらの結果は,ドナーDNAメチル化が,発見コホートにおける最初の有望な結果にもかかわらず,無関係ドナーを含むHCT設定におけるaGVHDの適切な予測因子ではないかもしれないことを示す。本研究は,特に臨床利用を意図した分類器を開発するとき,機械学習分類器の独立した検証の重要性を強調する。【JST・京大機械翻訳】

, , , , , , , , , , , ,
, , , 【Automatic Indexing@JST】

血液疾患の治療一般 , 免疫性疾患・アレルギー性疾患一般

, , , , , ,

前のページに戻る