ヒト癌におけるTHAP9/THAP9-AS1センス-アンチセンス遺伝子対の予後的可能性を明らかにする汎癌解析【JST・京大機械翻訳】

Rashmi, R.; Majumdar, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202201329512290 整理番号：22P0312913

ヒト癌におけるTHAP9/THAP9-AS1センス-アンチセンス遺伝子対の予後的可能性を明らかにする汎癌解析【JST・京大機械翻訳】

Pan-cancer analysis reveals the prognostic potential of THAP9/THAP9-AS1 Sense-Antisense gene pair in human cancer.

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発行年： 2022年01月24日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月24日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ヒトTHAP9はDrosophila P-要素トランスポザーゼ(DmTNP)と相同な馴化トランスポゾンである。しかし,THAP9の正確な機能的役割は不明である。THAP9-AS1(THAP9-抗センス1)は様々な癌に関与するlncRNAである。まとめると,それらは,センスおよびアンチセンス遺伝子対を形成する反対のDNA鎖上に頭から頭を配置する。汎癌展望からTHAP9とTHAP9-AS1を分析した研究はない。最初に,コアプロモーター要素とCPG諸島に対するTHAP9とTHAP9-AS1間の双方向プロモーター領域を分析した。さらに,癌ゲノムAtlasおよびGTExデータセットに含まれる異なるタイプの腫瘍にわたる2つの遺伝子の発現,予後および生物学的機能を分析した。結果は,両遺伝子の発現が異なる腫瘍で異なることを示した。THAP9とTHAP9-AS1遺伝子対の発現は,腫瘍患者の予後と強く相関することが観察された。2つの遺伝子の高い発現は,通常,不良な全体的および無病生存にリンクした。したがって,それらは臨床腫瘍予後の潜在的バイオマーカーとして役立つ可能性がある。さらに,WGCNAを用いて遺伝子共発現分析を行い,22の癌にわたって異なる遺伝子相関解析(DGCA)を行い,どの遺伝子が発現パターンTHAP9とTHAP9-AS1を共有し,それらの相互作用パートナーが様々な条件で変化するかを調べた。2つの遺伝子で共発現された遺伝子の遺伝子オントロジーとKEGG経路分析は,DNA結合とHerpes simplex virus 1感染に関連する遺伝子濃縮を同定した。【JST・京大機械翻訳】

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生物学的機能 , 細胞構成体一般 , 分子遺伝学一般

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