ヒトに適応するSARS-CoV-2の遺伝子突然変異の発見:中国,米国およびヨーロッパからの2594ゲノムの宿主ゲノム類似性解析【JST・京大機械翻訳】

Sun, W.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202201611251122 整理番号：22P0246855

ヒトに適応するSARS-CoV-2の遺伝子突然変異の発見:中国,米国およびヨーロッパからの2594ゲノムの宿主ゲノム類似性解析【JST・京大機械翻訳】

The discovery of gene mutations making SARS-CoV-2 well adapted for humans: host-genome similarity analysis of 2594 genomes from China, the USA and Europe

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発行年： 2020年09月03日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年09月03日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)は,長さ約30kbの陽性センス一本鎖ウイルスであり,進行中の新規コロナウイルス疾患-2019(COVID-19)を引き起こす。研究は,SARS-CoV-2とSARS-CoVの間の有意なゲノム差を確認し,病原性の区別がゲノム多様性に関連するかもしれないことを示唆する。しかし,ゲノム差とSARS-CoV-2適応度の間の関係は,特にオープンリーディングフレーム(ORF)コード化アクセサリー蛋白質について完全には説明されていない。RNAウイルスは高い突然変異率を持つが,SARS-CoV-2変異が適応をどのように加速するかは明らかではない。本研究は,SARS-CoV-2の宿主-ゲノム類似性(HGS)が,特にin vivoで先天性免疫を拮抗する蛋白質をコードするORF6とORF8遺伝子において,SARS-CoVのそれより有意に高いことを示した。ORF3b,ORF6およびNのHGSとインターフェロン(IFN)感受性応答要素(ISRE)含有プロモーターの発現の間にべき乗則関係を発見した。この知見は,SARS-CoV-2ゲノムの高いHGSがIFN I合成をさらに阻害し,遅延した宿主先天性免疫を引き起こすことを意味する。ORF1ab突然変異,10818G>Tは,高いHGSを有するウイルス集団において発生したが,低いHGS集団においてまれに,中国,米国およびヨーロッパの地理配置を有する2594のゲノムにおいて同定された。10818G>Tは膜貫通蛋白質nsp6においてアミノ酸変異M37Fを引き起こした。結果は,ORF6とORF8遺伝子と突然変異M37FがCOVID-19を引き起こす際に重要な役割を果たすかもしれないことを示唆する。所見は,HGS分析が適応株の重要な遺伝子および変異を同定する有望な方法であり,これは薬剤に対する潜在的標的の探索を助けることを示す。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

ウイルスの生化学 , ウイルス感染の生理と病原性

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