主要ヒト病原体A群連鎖球菌における主要補因子HPrの有無によるin vivo CcpA結合の全ゲノム解析【JST・京大機械翻訳】

DebRoy, S.; Tobar, V. A.; Galvez, G.; Arora, S.; Liang, X.; Horstmann, N. M.; Maracaja-Coutinho, V.; Latorre, M.; Hook, M.; Flores, A. R.; Shelburne, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202201772721927 整理番号：22P0246331

主要ヒト病原体A群連鎖球菌における主要補因子HPrの有無によるin vivo CcpA結合の全ゲノム解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide analysis of in vivo CcpA binding with and without its key co-factor HPr in the major human pathogen group A Streptococcus.

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著者 (11件)： , , , , , , , , , ,
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発行年： 2020年08月28日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年08月28日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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カタボライト制御蛋白質A(CcpA)は炭素源利用のマスター調節因子であり,多数の医学的に重要なグラム陽性菌の病原性に寄与する。重要な共因子HPrとの相互作用を含むCcpAのほとんどの機能的評価を非病原性細菌で実施した。この研究では,CcpAのin vivo DNA結合プロファイルを同定し,HPrが主要なヒト病原体群A Streptococcus(GAS)でCcpAが仲介する調節とDNA結合に必要な程度を評価することを目的にした。組合せRNAeq/ChIPseqアプローチを用いて,CcpAが1667GAS遺伝子(31%)の514の転写レベルに影響するが,直接DNA結合は105GAS遺伝子に対して同定された。3つの直接調節遺伝子は,重要なGAS病原性因子Streptolysin S,PrtS(IL-8分解プロテイナーゼ)およびSpeB(システインプロテアーゼ)をコードする。CcpA Val301のAlaへの変異(2221-CcpA-V301A)は,CcpAとHPr間の相互作用を消失させ,総CcpAレギュロンにおける205遺伝子(40%)の転写レベルに影響した。ChIPseq分析により,CcpAV301Aは野生型CcpAにより結合した遺伝子の74%からDNAに結合したが,一般的に低い親和性を示した。これらのデータは直接CcpAレギュロンを描写し,重要な病原性細菌におけるCcpAのHPr依存性及び非依存性活性を明らかにした。データ共有とデータアベイラビリティは,本研究の知見を支持するデータが,合理的な要求で対応する著者から利用可能である。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現 , 微生物感染の生理と病原性

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