胚乳および集団レベル分析におけるゲノムインプリンティングのゲノムワイドスクリーニングは亜麻におけるインプリンティングの対立遺伝子変異を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Jiang, H.; Guo, D.; Ye, J.; Gao, Y.; Liu, H.; Wang, Y.; Xue, M.; Yan, Q.; Chen, J.; Duan, L.; Li, G.; Li, X.; Xie, L.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202201785957997 整理番号：22P0253671

胚乳および集団レベル分析におけるゲノムインプリンティングのゲノムワイドスクリーニングは亜麻におけるインプリンティングの対立遺伝子変異を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide screen of genomic imprinting in endosperm and population-level analysis reveal allelic variation for imprinting in flax

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発行年： 2020年11月20日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年11月20日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ゲノムインプリンティングは母性及び父性遺伝対立遺伝子の偏った発現により起きるエピジェネティック現象である。開花植物において,ゲノムインプリンティングは主に三倍体内胚乳で生じ,種子発生において重要な役割を担っている。本研究では,143の母性発現刷込遺伝子(MEGs)を含む241の候補刷り込み遺伝子,およびディープRNA配列決定を用いてアマ(Linum usitatissimum L.)胚乳における98の父性発現刷込遺伝子(PEG)を同定した。植物におけるインプリンティングの保存は非常に限られ,インプリンティングクラスタ化は一般的な特徴ではない。MEGsは胚乳発現特異的であり,一方,PEGは非組織特異的であった。印刷したSNPは200亜麻品種をオイル亜麻,オイル繊維二重目的亜麻(OF)及び繊維亜麻サブグループに分化し,ゲノムインプリンティングがアマの種内変異に寄与することを示唆した。オイル亜麻サブグループにおける刷込遺伝子のヌクレオチド多様性({pi})は,繊維亜麻亜群のそれよりも有意に高く,いくつかの刷込遺伝子が油亜麻から繊維亜麻へのアマ栽培中に正の選択を受けることを示した。刷り込み遺伝子は正の選択を受け,機能に関連する。種子サイズと重量に関連した11の刷り込み遺伝子を,候補遺伝子ベースの関連研究を使用して同定した。本研究は,アマ個体群における刷込遺伝子の機能およびゲノム変異をさらに探索するための情報を提供する。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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