発生中の心臓の時空間単一細胞RNA配列決定は細胞分化と形態形成間の相互作用を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Mantri, M.; Scuderi, G. J.; Nassab, R. A.; Wang, M. F. Z.; McKellar, D.; Butcher, J. T.; De Vlaminck, I.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202201847482974 整理番号：22P0233622

発生中の心臓の時空間単一細胞RNA配列決定は細胞分化と形態形成間の相互作用を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Spatiotemporal single-cell RNA sequencing of developing hearts reveals interplay between cellular differentiation and morphogenesis

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発行年： 2020年05月03日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年05月03日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

単一細胞RNA配列決定は,発生生物学を研究するための強力なツールであるが,細胞相互作用および組織形態に関する空間的情報を保存するものではない。ここでは,単一細胞及び空間トランスクリプトミクスを,ニワトリ心臓の初期発達を研究するためのデータ統合のための新しいアルゴリズムと組み合わせた。早期室形成段階から後期4室段階までの4つの重要な心室発達段階からのデータを集めた。発育中の心臓,それらの空間構成,およびそれらの相互作用における多様な細胞系統のアトラスを作成した。分化遷移の空間的マッピングは,心臓細胞系統における細胞分化と形態形成の間の複雑な相互作用を明らかにした。空間的に分解された発現解析を用いて,解剖学的に制限された遺伝子発現プログラムを同定した。最後に,多系統細胞集団の協調における小分泌ペプチド,チモシンベータ-4の段階依存性役割を発見した。全体として,本研究は心臓発生を支配する重要な段階特異的調節プログラムを同定した。【JST・京大機械翻訳】

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発生と分化 , 細胞生理一般

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