3D DNA構造バーコードコピーとランダムアクセス【JST・京大機械翻訳】

Boskovic, F. N.; Ohmann, A.; Keyser, U. F.; Chen, K.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202201859753949 整理番号：22P0254294

3D DNA構造バーコードコピーとランダムアクセス【JST・京大機械翻訳】

3D DNA structural barcode copying and random access

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発行年： 2020年11月27日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年11月27日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

DNA自己集合を介して構築された3次元(3D)DNAナノ構造は,多重バイオセンシングおよびデジタル情報保存における最近の応用を確立した。しかし,重要な挑戦は,3D DNA構造が,それらの大規模生産と標的特異的増幅による望ましい分子へのアクセスにとって極めて重要である,容易にコピーされないことである。ここでは,3D DNA構造バーコードを構築し,修飾ポリメラーゼ鎖反応(PCR)を用い,分子のライブラリーからバーコードのコピーとランダムアクセスを示した。3Dバーコードは,定義された位置に3D突起を含む相補的な短いオリゴヌクレオチドで一本鎖DNA足場をアニーリングすることにより組み立てられた。これらの構造のDNAニックは,PCRを用いてバーコードコピーを容易にするために結紮される。バーコードのライブラリーからターゲットをランダムにアクセスするために,バーコード特異的プライマーテンプレートとして機能するDNA構築物の非相補的末端を採用した。3D DNA構造バーコードの読み出しをナノポア測定により行った。本研究は,大量の自己集合3D DNAナノ構造を簡便に生産するためのロードマップを提供した。さらに,この戦略は,多重単一分子センシングおよびDNAデータ貯蔵のための重要な能力である特異的標的へのアクセスを提供する。【JST・京大機械翻訳】

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核酸一般 , バイオアッセイ

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