測地曲率駆動蛋白質-膜界面を持つ蛋白質誘導膜形態の計算モデル【JST・京大機械翻訳】

Zhou Y. C.; Argudo David; Marcoline Frank; Grabe Michael

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202201906231476 整理番号：22P0164049

測地曲率駆動蛋白質-膜界面を持つ蛋白質誘導膜形態の計算モデル【JST・京大機械翻訳】

A Computational Model of Protein Induced Membrane Morphology with Geodesic Curvature Driven Protein-Membrane Interface

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発行年： 2020年06月25日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年06月25日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

包埋蛋白質により誘導される二分子層膜形態学的動力学の連続体またはハイブリッドモデリングは,蛋白質-膜界面の同定と2つの表面の変形の結合を必要とする。本論文では,(i)これらの界面を記述する最小全測地線曲率モデル,および(ii)共通の中央環状体に対する各表面の共形写像による2つの表面間の数値1つのマッピングを開発した。本研究は,二分子層と埋め込まれた蛋白質の間の界面を決定するための最初の計算可能なアプローチを提供する。1つのマッピングは,2つの表面のモルフォロジーの便利な結合を可能にする。これら2つの新開発を蛋白質-膜相互作用のエネルギーモデルに統合し,結合系に対する数値法の完全なセットを開発した。数値例を示し,(1)高度に複雑な蛋白質表面上の最小全測地線曲率を持つ曲線の位置決定における著者らの方法の効率とロバスト性,(2)膜変形のための内部境界としてのこれらの界面の有用性,および(3)異なる蛋白質-膜界面に対する二層表面の豊富な形態を示した。【JST・京大機械翻訳】

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生体膜一般

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