Cenote-Taker2はウイルスの発見と配列アノテーションを民主化する【JST・京大機械翻訳】

Tisza, M. J.; Belford, A. K.; Dominguez Huerta, G.; Bolduc, B.; Sullivan, M. B.; Buck, C. B.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202127146639 整理番号：22P0247986

Cenote-Taker2はウイルスの発見と配列アノテーションを民主化する【JST・京大機械翻訳】

Cenote-Taker 2 Democratizes Virus Discovery and Sequence Annotation

出版者サイト {{ this.onShowPLink() }} 複写サービスで全文入手
高度な検索・分析はJDreamⅢで

この文献はプレプリントです。プレプリントについてはこちらをご確認ください。

著者 (6件)： , , , , ,
資料名：
発行年： 2020年09月16日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年09月16日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

ウイルスは,生物学的システムにおけるそれらの大きな豊度と重要性にもかかわらず,主に myしいままである。実際,惑星上のウイルス種の数百百万の大多数は未発見のままである。さらに,GenBankおよびRefSeqのような中心データベースに沈着した多くのウイルスは,”仮説蛋白質”または等価として注釈付けされた遺伝子でリターされる。Cente-Taker2は,コマンドライン上で利用可能なウイルス発見と注釈ツールであり,フリーな高性能計算アクセスを有するグラフィカルユーザインタフェイスにより,ユーザ入力コンティグから精通性または多様なウイルス配列を発見するために,特徴ウイルス遺伝子の高感度モデルを利用する。さらに,Cente-Taker2は,コンティグのシーケンス特徴を自動的に注釈付けするためのモジュールの柔軟な集合を使用し,比較可能なツールより多くの遺伝子情報を提供する。出力は可読性と対話型ゲノムマップ,ビローム要約表,およびGenBankに直接提出できるファイルを含む。既知のビロームのウイルス発見,注釈,および拡大を容易にするために,Cente-Taker2を期待する。【JST・京大機械翻訳】

, , , , , , , , , ,
, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

分子・遺伝情報処理 , 遺伝子の構造と化学

, , ,

前のページに戻る