超高被覆率ナノポアデータを用いる繊毛虫大核ゲノムの完全テロメア-テロメア集合の戦略【JST・京大機械翻訳】

Wang, G.; Chai, X.; Zhang, J.; Yang, W.; Jiang, C.; Chen, K.; Miao, W.; Xiong, J.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202162577090 整理番号：22P0222501

超高被覆率ナノポアデータを用いる繊毛虫大核ゲノムの完全テロメア-テロメア集合の戦略【JST・京大機械翻訳】

A strategy for complete telomere-to-telomere assembly of ciliate macronuclear genome using ultra-high coverage Nanopore data

出版者サイト {{ this.onShowPLink() }} 複写サービスで全文入手
高度な検索・分析はJDreamⅢで

この文献はプレプリントです。プレプリントについてはこちらをご確認ください。

著者 (8件)： , , , , , , ,
資料名：
発行年： 2020年01月09日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年01月09日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

繊毛は2種類の核を含む:単一細胞における生殖系列小核(MIC)と体細胞マクロ核(MAC)。MACは通常断片化した染色体を持つ。両末端でテロメアでキャップしたこれらの断片化した染色体は,異なる繊毛虫類種間で数メガ塩基長の遺伝子サイズであった。これまでに,繊毛虫類における全MACゲノムのテロメアからテロメアへの集合は終了しない。第3世代配列決定技術の開発は,おそらく全MAC染色体をスパンできる長さでメガベースまでの配列決定読取りを生成させる。超長ナノポア読取を利用して,繊毛MACゲノムの完全な集合のための簡単な戦略を確立した。この戦略を用いて,著者らは,それぞれ181および214の染色体テロメアから成る2つの繊毛虫類種Tetrahymena thermophilaおよびTetrahymena shanghaiensisの完全なMACゲノムを組み立てた。確立された戦略および高品質ゲノムデータは,繊毛虫類ゲノムアセンブリのための有用なアプローチおよび更なる生物学的,進化的および個体群ゲノム研究のための貴重なコミュニティ資源を提供するであろう。【JST・京大機械翻訳】

, , , , , , , , , , ,
, , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子の構造と化学

, , , , , , ,

前のページに戻る