慢性感染免疫不全患者における2つの主要なSARS-CoV-2変異体間のSARS-CoV-2組換え体の逐次出現と分離【JST・京大機械翻訳】

Burel, E.; Colson, P.; Lagier, J.-C.; LEVASSEUR, A.; Bedotto, M.; Lavrard, P.; Fournier, P.-E.; LA SCOLA, B.; Raoult, D.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202185390299 整理番号：22P0321788

慢性感染免疫不全患者における2つの主要なSARS-CoV-2変異体間のSARS-CoV-2組換え体の逐次出現と分離【JST・京大機械翻訳】

Sequential appearance and isolation of a SARS-CoV-2 recombinant between two major SARS-CoV-2 variants in a chronically infected immunocompromised patient

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発行年： 2022年03月23日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月23日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

遺伝子組換はRNAウイルス間の主要な進化機構であり,ヒトに感染するそれらを含むコロナウイルスにおいて一般的である。少数のSARS-CoV-2組換え体は,ゲノムが異なる変異体または変異体から変異の組み合わせを有すると報告されているが,単一患者試料は分析され,ウイルスは分離されなかった。ここでは,14箇月間慢性的に感染したリンパ腫患者におけるB.1.160とアルファ変異体のハイブリッドゲノムの漸進的な生成を再検討し,組換えウイルスを分離した。ハイブリッドゲノムは次世代シークエンシングにより得られ,組換え部位はPCRにより確認された。これは,アルファ変異体からスパイク遺伝子を含む2つの断片で散在する親のB.1.160骨格から成る。患者からの7つの連続したサンプルの分析は,B.1.160変異体による初期感染,次にこの変異体とアルファ変異体による同時感染,ハイブリッドゲノムの生成,および最終的に患者追跡調査の最後で分離された優勢な組換えウイルスの出現を含む組換え段階を解読した。この症例は,実際の生活におけるSARS-CoV-2の組換え過程を示し,異なるSARS-CoV-2変異体で共感染する患者におけるゲノム監視の強化と,いくつかのRNAウイルスとのより遺伝子的で,これは新しいウイルスの生成につながる可能性がある。【JST・京大機械翻訳】

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ウイルスの生化学 , ウイルス感染の生理と病原性

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