高密度ペプチドマイクロアレイ相互作用により評価したHLAクラスII特異性【JST・京大機械翻訳】

Osterbye, T.; Nielsen, M.; Dudek, N. L.; Ramarathinam, S. H.; Purcell, A. W.; Schafer-Nielsen, C.; Buus, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202239604001 整理番号：22P0227164

高密度ペプチドマイクロアレイ相互作用により評価したHLAクラスII特異性【JST・京大機械翻訳】

HLA-class II specificity assessed by high-density peptide microarray interactions

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発行年： 2020年03月03日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年03月03日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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MHC結合ペプチドを予測し,同定する能力はT細胞エピトープ発見の必須成分である。最終的には,ワクチンと免疫療法の開発に役立つ。特に,MHCクラスI(MHC-I)予測ツールは,最適ペプチドエピトープの正確な選択が実質的に全てのMHC-Iアロタイプに対して可能である点に成熟している。比較すると,現在のMHCクラスII(MHC-II)予測因子は,より成熟していない。MHC-IIはCD4 ̄+T細胞を制御し,大部分の免疫応答を調節するので,この欠点は効果的な免疫療法の開発を厳しく妨げる。ペプチドの大きなパネルを生成する能力およびペプチド-MHC-II相互作用データの大きな体は,この問題の解決に重要である。また,バイオインフォマティクス予測子の改善を支持する解決策は,大量の正確,多様で代表的なデータの利用可能性に決定的に依存する。ここでは,組換えHLA-DRB1*01:01およびHLA-DRB1*03:01分子を用いて,70,000のランダムペプチドを含むcasuにおいて,高密度ペプチドアレイを3回に取り込んだ。取得した結合データは,検討したHLA-DR分子の特異性を反映する系統的で解釈可能な情報を含むことを示した。まとめると,ペプチド当りのコストが組換えHLA技術の柔軟性と組み合わさった数%に減少したので,これは前例のない速度でMHC-II結合データの広大な体を生成し,またペプチド-MHC-II結合データを生成し,MHC-II予測ツールを改善する利点のために魅力的な戦略をもたらした。【JST・京大機械翻訳】

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免疫反応一般

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