プレプリント
J-GLOBAL ID:202202202301131719   整理番号:22P0228652

形態学的に分岐した分類群の発根 ゆっくり進化する配列データは助けとなる【JST・京大機械翻訳】

Rooting morphologically divergent taxa - slow-evolving sequence data might help
著者 (5件):
資料名:
発行年: 2020年03月17日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2020年03月17日
JST資料番号: O7001B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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化石がまばらで,研究した系統が形態学的に多様である場合,形態のみに基づく分析は相反する予想外の仮説につながる可能性がある。保存的遺伝子/遺伝子領域からのデータの統合を通して,これらのデータを含む端末は,探索を固定または制約し,それによって,組合せ解析の探索空間を実際に囲むことができる。本研究では,コケ類の高度に分岐したグループ,クラスPolytrichopsidaの系統発生を再検討した。著者らは,核遺伝子18S,葉緑体遺伝子rbcLおよびrps4,およびミトコンドリア遺伝子nad5の配列データを加えることによって,形態学的マトリックスを補足した。系統発生解析のために,最適性基準として節約を用いた。すべての端末を含む分析は,Alophosiaアゾリカと基底-最系統を代表する化石平均トイナ属alophosioidesから成るクレードを持つ1つの最も節約的な樹木をもたらした。異なるグループサンプリングによる分析は,ほとんどのグループ関係で同じトポロジーを生成した。形態学的特徴および形態学的特徴のみ(2つの化石および2つの現存端末)が記録された4つの端末を除外した分析は,すべての端末を含むときに得られたものと同一のトポロジーを有する1つの最適木をもたらした。これらの結果は,多数の端末のシーケンスレベルデータのみに基づく最近の解析で得られたものと一致した。結果は,配偶体の大きなサイズと複雑性が,いくつかの系統で独立して進化したことを示す。特に,最も簡素な木のバックボーンのノードは,非常に低いサポート値を持ち,従って,これらの推論関係は,現在のデータと新しい付加的情報コンフリクトがあれば,変化する可能性がある。将来の研究は,系統発生分析にすべての端末を組み込むことを目的とし,それは200種未満のグループに対する非現実的な目標ではない。また,追加の化石,その幾つかは詳細な検査と記述を待つ必要がある。これらがここで提示した系統発生の全体的パターンに影響するかどうかは,まだ見つかっていない。明らかに非常に古いグループでは,現在知られている化石分類群は,140Ma以下の時期に戻る,現在知られている化石分類群は,グループの最古の系統を代表する。【JST・京大機械翻訳】
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, 【Automatic Indexing@JST】
分類 (3件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
植物分類学  ,  進化論一般  ,  動物分類学 
タイトルに関連する用語 (5件):
タイトルに関連する用語
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