OmicronとDelta感染を区別するためのRdRp標的遅延の診断PCR代理マーカーを用いた南アフリカ西部ケープ州におけるOmicron変異体の臨床的重症度の評価:生存解析【JST・京大機械翻訳】

Hussey, H.; Davies, M.-A.; Heekes, A.; Williamson, C.; Valley-Omar, Z.; Hardie, D. R.; Korsman, S.; Doolabh, D.; Preiser, W.; Maponga, T.; Iranzadeh, A.; Wasserman, S.; Schreuder, N.; Boloko, L.; Symons, G.; Raubenheimer, P.; Viljoen, B.; Solomon, W.; Rousseau, P.; Parker, A.; Wolter, N.; Cohen, C.; JASSAT, W.; Lessels, R.; Wilkinson, R. J.; Boulle, A.; Hsiao, N.-y.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202417713995 整理番号：22P0034369

OmicronとDelta感染を区別するためのRdRp標的遅延の診断PCR代理マーカーを用いた南アフリカ西部ケープ州におけるOmicron変異体の臨床的重症度の評価:生存解析【JST・京大機械翻訳】

Assessing the clinical severity of the Omicron variant in the Western Cape Province, South Africa, using the diagnostic PCR proxy marker of RdRp target delay to distinguish between Omicron and Delta infections: a survival analysis

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資料名：
発行年： 2022年01月14日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月14日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

【背景】新たなデータは,SARS-CoV-2 Omicron変異体(VOC)が重症疾患のリスク低下と関連することを示唆する。この程度は,Omicronの固有の病原性の違い,または集団免疫のより高いレベルを反映する程度は,現在明らかではない。【方法】Seegene Allplex 2019-nCoV PCRアッセイにおけるRdRp標的遅延(RTD:RdRp-E>3.5のサイクル閾値における差)は,デルタVOCの代理マーカーであった。Omicronへの移行期間におけるこの代理マーカーの欠如を用いて,疑わしいOmicron VOC感染を同定した。コックス回帰は,南アフリカ,西アフリカ,南アフリカの1月1日から12月2021日までのSeegene AllplexアッセイでSARS-CoV-2陽性の病院入院の転帰について行われた。診断時のワクチン接種状況,および以前の診断感染および共存症を,調整した。【結果】RTDを有する150症例(デルタのためのプロキシ)とRTDのない1486症例(Omicronのためのプロキシ)を含んだ。RTDのない症例は,入院のより低い危険性(調整ハザード比[aHR]0.56,95%信頼区間[CI]0.34~0.91)を有した。完全なワクチン接種は,0.45(95%CI0.26~0.77)のaHRによる入院の保護であった。【結論】Omicronは,RTDの代理マーカーを使用するとき,Western Cape Provinceにおける同時性Delta感染と比較して,入院のより低いリスクをもたらした。Omicronのような免疫回避変異体による再感染は,変異体毒性を正確に評価する挑戦である。【JST・京大機械翻訳】

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ウイルスによる植物病害 , ウイルスの生化学

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