Tapestry:長い読取を持つ小型真核生物ゲノムアセンブリの検証と編集【JST・京大機械翻訳】

Davey, J. W.; Davis, S. J.; Mottram, J. C.; Ashton, P. D.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202202419583959 整理番号：22P0232690

Tapestry:長い読取を持つ小型真核生物ゲノムアセンブリの検証と編集【JST・京大機械翻訳】

Tapestry: validate and edit small eukaryotic genome assemblies with long reads

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発行年： 2020年04月25日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年04月25日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

長い読取に基づくSummarySmall真核生物ゲノムアセンブリは,しばしば完全に近いが,まだ検証と編集を必要とする。GC含有量,テロメア,読取深度,コンティグアラインメント,および読取アラインメントを考慮して,生ゲノムアセンブリにおけるコンティグを検証,分類,およびフィルターにかけるのに使用できる対話型レポートを,タペストリーは生産する。報告は協力者と共有でき,出版物中の補足材料として含まれている。アベイラビリティSourceコードはhttps://github.com/johnomics/tapestryで自由に利用可能である。包装はBioconda(https://anaconda.org/bioconda/tapestry)で自由に利用可能である。接触john.davey@yok.ac.uk.【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

分子・遺伝情報処理 , 遺伝子の構造と化学

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