抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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生物学的多様化の多くのプロセスは複数の進化系統に同時に影響する。染色体の領域が重複しているとき,遺伝子ファミリー分岐の多重メンバー,”超拡大”事象で分岐する複数のウイルス株,および種の全群落を断片化する地質学的事象を含む。そのような過程によって予測される共有発散のパターンをテストすることは困難であり,すべての系統学的方法は,系統が独立して分岐すると仮定する。共有および多分岐発散を持つツリーを含むトポロジーの空間を拡張することにより,独立,分岐の仮説を緩和するためのBayes系統発生アプローチを導入した。これは,複数の進化的系統に同時または2つの子孫系統以上をもたらす多様化の過程によって予測される分岐の系統発生関係,発散時間,およびパターンを同時に推論することを可能にする。シミュレーションを用いて,著者らは,それらが生起するとき,共有および多分岐発散事象を正確に推論し,そして,発散が独立で分岐しているとき,現在の系統発生法と同様に実行することを発見した。フィリピンを横断した2属のgeckosのゲノムデータに著者らの新しい方法を適用し,島景観への過去の変化がスペシエーションのバーストを引き起こすかどうかを試験した。gecko集団の対のみに限定した以前の解析とは異なり,共有発散のパターンの証拠を見出した。尤度モデルに依存しない方法で系統樹の空間を一般化することによって,著者らのアプローチは,ライフサイエンスにわたる多様化のプロセスへの将来の研究のための多くの道を開いた。Signification Statement Phylogeneticモデルは,系統が独立して分岐していると長い間仮定されてきた。生物地理,疫学およびゲノム進化に興味がある多様化の過程は,複数の進化系統に影響することによりこの仮定を破る。そのような過程によって予測された発散の独立した発散と推論パターンの仮定を緩和するために,著者らは,系統樹を概念化,モデリング,および推論する新しい方法を導入した。フィリピン全域に分布するgeckosのゲノムデータに新手法を適用し,海水準における間氷期上昇によるアーカイペラゴの反復フラグメンテーションによって予測される共有発散のパターンに対する支持を見出した。【JST・京大機械翻訳】
